Локус — это… Что такое Локус?

Локус(ы) — * локус(ы) * locus(es) 1. Место расположения определенного гена (конкретных его аллелей) на хромосоме или внутри сегмента геномной ДНК. 2. Местоположение данной мутации или гена на генетической карте. Часто используется вместо терминов «мутация»… …   Генетика. Энциклопедический словарь

ЛОКУС — (лат. locus) место локализации определенного гена на генетической карте хромосомы …   Большой Энциклопедический словарь

ЛОКУС — (от лат. locus место), местоположение определённого гена (его аллелей) на генетич. или цитологич. карте хромосомы. Иногда термин «Л.» неоправданно используют как синоним термина «ген». .(Источник: «Биологический энциклопедический словарь.» Гл.… …   Биологический энциклопедический словарь

локус — а, м. ( …   Словарь иностранных слов русского языка

ЛОКУС — (от лат. locus место), местонахождение данного гена в хромосоме. Экологический энциклопедический словарь. Кишинев: Главная редакция Молдавской советской энциклопедии. И.И. Дедю. 1989 …   Экологический словарь

Локус — местоположение определенного гена (его аллелей) на хромосоме… Источник: МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ПРОГНОЗИРОВАНИЕ, РАННЯЯ ДОКЛИНИЧЕСКАЯ ДИАГНОСТИКА И ПРОФИЛАКТИКА ИНСУЛИНЗАВИСИМОГО САХАРНОГО ДИАБЕТА (N 15) (утв. председателем Комитета… …   Официальная терминология

локус — сущ., кол во синонимов: 1 • место (170) Словарь синонимов ASIS. В.Н. Тришин. 2013 …   Словарь синонимов

локус — Местоположение аллельного гена в хромосоме [http://www.dunwoodypress.com/148/PDF/Biotech Eng Rus.pdf] Тематики биотехнологии EN locus …   Справочник технического переводчика

Локус — У этого термина существуют и другие значения, см. Локус (значения). Схематичное изображение хромосомы: (1) Хроматида, одна из двух идентичных частей хромосомы после S фазы. (2) Центромера, место, в котором хроматиды со …   Википедия

локус — (лат. locus), место локализации определенного гена на генетической карте хромосомы. * * * ЛОКУС ЛОКУС (лат. locus), место локализации определенного гена на генетической карте хромосомы …   Энциклопедический словарь

локус — locus локус. Mестоположение гена (или конкретных его аллелей) на карте хромосом организма; часто термин “Л.” неоправданно используется вместо термина “ген” <gene>. (Источник: «Англо русский толковый словарь генетических терминов». Арефьев В …   Молекулярная биология и генетика. Толковый словарь.

Значение, Определение, Предложения . Что такое локус

Если я смогу выцепить генетический локус двух кандидатов и сверить его с мутацией профессора, у меня получится найти кандидата и спасти ему жизнь.

Мой локус контроля совершенно внешний.

Что если Локус Солус попытается отбить его?

А разве локус церулеус должен так кровоточить?

Accelerando получил премию Локус за Лучший научно-фантастический роман 2006 года и премию эстонской НФ 2010 года за лучший переведенный Роман 2009 года.

Это фундаментальная плоскость горизонтальной системы координат, локус точек, имеющих высоту в ноль градусов.

В том же году роман был номинирован на премию Локус.

Тристиловые растения содержат, помимо локуса S, локус M, также с двумя аллелями.

Считается, что локус coeruleus-норадренергическая система опосредует чрезмерную консолидацию памяти страха.

Затем, когда скалярный t изменяется, x дает локус линии.

В 1978 году он получил премию Локус за лучший фантастический роман.

Однако один локус отвечает примерно за 80% вариации.

У лемуров различия между голубыми и карими глазами полностью неизвестны, но один и тот же локус Гена не участвует.

Другие исследователи полагают, что вера в заблуждение может быть результатом ошибочной веры во внутренний локус контроля.

Современные модели включают мезокортиколимбический дофаминовый путь и Локус coeruleus-норадренергическую систему.

Кроме того, они обнаружили, что случайный локус ориентации на контроль является еще одной индивидуальной характеристикой, которая положительно связана с моральной отстраненностью.

Ортотомия кривой-это ее педаль, увеличенная в 2 раза так, что центр подобия равен P. Это локус отражения P через касательную линию T.

Интервал также может быть определен как локус точек на заданном расстоянии от центра, и это определение может быть расширено от вещественных чисел до комплексных чисел.

В восемнадцатом веке ученые искали локус ностальгии, ностальгическую кость.

Роман был номинирован на премию Хьюго и премию Локус за лучший роман.

В силу своего статуса центров культуры и грамотности города можно охарактеризовать как локус цивилизации, мировой истории и социальных изменений.

Каждый локус содержит одну аллель гена; однако члены популяции могут иметь различные аллели в локусе, каждый из которых имеет немного различную последовательность генов.

Полученный корневой локус прослеживает единичный круг.

Количественные психологические исследования-количественная психология-количественный локус признака-квантовая психология.

SATB1 организует локус MHC класса I в отдельные петли хроматина, привязывая Марс к ядерной матрице на фиксированных расстояниях.

Локус coeruleuses этих животных, по-видимому, дезактивирован.

Специфическое расположение последовательности ДНК в хромосоме известно как локус.

Даже если локус гена гетерозиготен на уровне последовательности ДНК, белки, образуемые каждым аллелем, могут быть идентичны.

Генетический проект — это воздействие на локус путем отбора на связанные локусы.

Отбор действует не на один локус, а на фенотип, который возникает в результате развития из полного генотипа.

Связь-это проблема для популяционных генетических моделей, которые одновременно обрабатывают один локус гена.

Несколько примеров локусов, которые были изучены, — это область 17q21, локус 3p24-26, PTEN, 15q11. 2-q13 и делеция в области 22q11. 2.

Каждый генетический локус всегда представлен двумя буквами.

Одним из популярных фокусов для снятия отпечатков пальцев был локус D1S80.

Норадреналин, который участвует в возбуждении, поступает исключительно из близлежащей небольшой области, называемой локус coeruleus.

Генетический проект — это воздействие на локус путем отбора на связанные локусы.

Каждый генетический локус всегда представлен двумя буквами.

Не смотрите только на гаплогруппы Y-ДНК — разве вы не знаете, что гаплогруппы Y-это всего лишь 1 локус из миилионов.

Занял 8-е место в номинации Локус-премия за лучшую новеллу 1999 года.

Ситцевые кошки почти всегда женского пола, потому что локус гена оранжевой / не оранжевой окраски находится на Х-хромосоме.

Связанный с полом оранжевый локус, о/о, определяет, будет ли кошка производить эумеланин.

Социокультурная теория предсказывает, что мотивация имеет внешний локус причинности и социально распределена между социальными группами.

Бесплодный локус гена также контролирует экспрессию сотен других генов, любое подмножество которых может фактически регулировать поведение.

На третьем изображен локус изотермической цветности на диаграмме цветности CIE 1931 x, Y.

Восковой кукурузы локус кодирует для белка СГЗ.

Радикальная плоскость — это локус центров всех сфер, которые ортогональны всем сферам в карандаше.

Они генетически сопоставили локус FASPS с хромосомой 2q, где тогда было очень мало секвенирования генома человека.

Она также заняла 25-е место в номинации Локус 2007 года за лучшую антологию.

Рассмотрим один локус гена, отобранный из двух гаплоидных особей в популяции.

Эвольвента кривой-это локус точки На куске натянутой струны, поскольку струна либо развернута, либо обернута вокруг кривой.

Другие страницы, которые увеличились, были деформация, правило, пузырь, прокуратор, отражение, земляной орех, Славка, контроль и Локус.

Мне кажется, что локус дискуссии по поводу последних правок вращается вокруг нескольких моментов.

Журналы могут организовывать опросы читателей, в частности премию Локус.

Локус контроля — это одно из главных влияний стиля атрибуции.

Но он эффективно функционировал как локус для сопоставления денег и голосов заинтересованных групп с бюрократической властью и опытом.

Другие результаты

Краткий словарь генетических терминов

Краткий словарь основных понятий и терминов, использующихся в генетике

Для понимания того, с чем работает наша компания и зачем эта работа нужна, какие результаты мы получаем и что они вам расскажут, можно прийти на консультацию к специалистам ЦГРМ «ГЕНЕТИКО». А для того, чтобы Вы не забыли, о чем был разговор, и не утонули в море новой информации, мы составили для Вас небольшой словарик основных понятий и терминов, использующихся в генетике.

Основным положением биологической науки является то, что клетка – это самое маленькое из возможных проявление жизни и что новая клетка может появиться только от уже существующей и никак не может возникнуть сама по себе. Конечно, это приводит к большому количеству вопросов о том, как зародилась жизнь и каким образом могла сформироваться самая первая клетка. Но для удобства будем считать обозначенные положения верными в современной реальности планеты Земля, где мы живем. Несмотря на невообразимо огромное разнообразие живых существ, все они состоят из клеток. И у всех клеток есть схожие черты, которые обусловлены самыми простыми жизненными необходимостями. Во-первых, клетка должна как-то отделяться от внешнего пространства – для этого есть специальная оболочка.

Во-вторых, клетка должна питаться – для этого есть разные системы, способные преобразовать энергию света или химических связей в необходимые для жизни вещества и удобную для использования энергию. И еще клетка умеет размножаться. Для выполнения всех этих функций необходимы механизмы, основу которых составляют белки и РНК. А вот инструкция, как эти молекулы должны выглядеть и работать, хранится в специальном отсеке клетки – ядре – в виде ДНК. Ошибки в этой инструкции, которая разрабатывалась миллионы лет, приводят к смерти клетки. А в многоклеточном организме, таком, как у человека, например, клетки взаимодействуют друг с другом, поэтому нарушение в работе одной или нескольких клеток может привести не к смерти всего организма, а к нарушениям его работы – заболеваниям. Также необходимо помнить, что человеческий организм огромная система, ансамбль миллионов разнообразных маленьких организмов, которые выросли из одной единственной клетки – зиготы – результата слияния яйцеклетки и сперматозоида.

ДНК – ДезоксиРибонуклиновая Кислота – полимер, то есть молекула с большим количеством последовательно повторяющихся структурных элементов, который несет всю информацию о генах и белках, необходимых для жизни всего организма. ДНК является картотекой, библиотекой и матрицей, с которой считывается информация в определенной последовательности и определенных условиях, разъяснения о которых записаны как в самой ДНК, так и с помощью различных дополнительных модификаций этой молекулы. Каждой хромосоме соответствует 1 молекула ДНК. Структурными блоками этого полимера являются дезоксирибонуклеотиды (=нуклеотиды), которые бывают 4х видов (А, Т, Г, Ц).

Последовательность ДНК – это то, в каком порядке в молекуле ДНК идут ее структурные элементы – нуклеотиды. Таким образом, генетической информацией является именно последовательность ДНК, а молекула ДНК является ее физическим носителем.

Хромосома – это молекула ДНК, специальным образом обернутая различными белками, которые помогают управляться с такой длинной молекулой, чтобы она не порвалась, не перепуталась с другими ДНК-молекулами и была физически доступна для белков, осуществляющих работу всего генетического аппарата.

РНК –РибоНуклиновая Кислота – полимер, который выполняет функциональную роль переносчика информации, то есть копии, которая делается с ДНК и используется для создания функциональных молекул: специальных РНК или белков. Специальные молекулы РНК могут не являться матрицами, на базе которых синтезируется белок, а сами выполняют структурные, ферментативные или транспортные функции. Главное, что последовательность структурных блоков в молекуле РНК всегда определена последовательностью ДНК соответствующего участка.

Белок – основная функциональная единица живой клетки с самым широчайшим спектром функций и возможностей. Как ДНК и РНК, является полимером, однако имеет химически иные структурные блоки – аминокислоты. Их последовательность, с одной стороны, напрямую зависит от соответствующей последовательности ДНК и может изменяться только в ограниченных и предусмотренных в ДНК инструкций, с другой стороны является основой структуры, в том числе пространственной, возможностей и функции белков разных типов.

Ген – определение гена включает два аспекта: теоретический и физический. Теоретически, то есть умозрительно, геном называют последовательность ДНК (слово, записанное на языке генетики), обладающее определенными свойствами. Как и слово в языке, ген является основой наследственной информации, в то время как различные другие структуры можно отнести к знакам препинания или вспомогательным элементам. Ген является подробной инструкцией для синтеза белка или специфической РНК, которую он кодирует. Причем эта инструкция описывает не только последовательность молекул, но и то в каких условиях и как они должны работать и выполнять свои функции. С физической, то есть материальной, точки зрения, ген – это часть молекулы ДНК с определенными структурными элементами. Как внутри слова есть приставка, корень, суффикс и окончание, позволяющие слову адаптироваться для каждой конкретной фразы, так и у гена есть промотор, экзоны и интроны. Первый обозначает начало гена, экзоны – это ключевая информация о последовательности РНК или белка, а интроны необходимы для регуляции и тонкой настройки работы гена в условиях разных тканей, органов и изменяющейся окружающей среды.

Экспрессия гена – это эффективность работы гена, так как для его функционирования недостаточно его наличия в геноме – с него должна считываться информация. Именно то, как часто и в каком объеме считывается информация с гена, выражают термином экспрессия.

Локус – участок молекулы ДНК, содержащий различный структурные элементы, в том числе один или несколько генов.

Геном– это последовательность всех молекул ДНК организма. Важно помнить, что в каждой клетке одного организма в норме содержатся одинаковые по количеству и последовательностям молекулы ДНК, а различается экспрессия конкретных генов.

Экзом – это последовательности ДНК экзомных участков генов, то есть так называемая основная кодирующая составляющая. Это то, с чем работает организм, в то время как остальная часть генома объясняет, как работать и в каких условиях как применять и настраивать кодирующую часть генома.

Мутация – изменение последовательности ДНК по сравнению другими клетками организма или другими представителями вида. Мутации могут возникать как из-за воздействия внешних неблагоприятных условий, так и из-за того, что наши ферменты работают пусть с редкими, но ошибками. Так как происходит физическое изменение в носителе информации – ДНК, такое изменение может передаваться из поколения в поколение.

Частота мутаций — относительное значение, показывающее у какой доли людей в геноме есть конкретная мутация. Частоту мутации можно рассчитать, как среднюю для всех людей, так и отдельно по расовым или национальным, или любы другим группам. В медицинской генетике под мутацией подразумевают изменение ДНК, которое может быть связано с каким-то заболеванием, и противопоставляют ее полиморфизму. Хотя по общей логике полиморфизм – это частный случай мутации.

Полиморфизм – нейтральная, а точнее безвредная, мутация, которая сравнительно часто встречается у какой-то группы организмов одного вида. Некоторые мутации встречаются часто у всех людей, некоторые – только среди представителей определенных рас или народностей.

Аллель – вариант последовательности гена в разном виде: от различия в одной букве последовательности до отсутствия целого куска последовательности или вставке лишнего. Эти различия возникают из-за мутации, которая могла произойти у далекого предка и передаться потомству через поколения. Таким образом, каждый ген у отдельного человека может быть представлен конкретным вариантом – аллелем. Для понимания аллелизма необходимо объяснить, что, например, различия в цвете глаз, волос, росте, чувствительности к алкоголю объясняются именно разными аллельными состояниями соответствующих генов.

Генотип – это все гены конкретной особи с указанием аллельного состояния каждого гена и наличия/отсутствия мутаций в межгенных участках ДНК.

Доминантный аллель. В геноме человека содержится по 2 копии каждой хромосомы. Это означает, что в каждом геноме есть две очень похожие по длине и последовательности генов молекулы ДНК, которые отличаются аллельными состояниями генов и мутациями/полиморфизмами в межгенных участках этих молекул ДНК. Из этого следует, что и каждый ген представлен в геноме 2 копиями, каждая из которых может быть определенным вариантом (аллелем) этого гена. Доминантным аллелем называется тот, одной копии которого достаточно для проявления его особенностей. То есть если хотя бы на одной из хромосом ген находится в состоянии доминантного аллеля, то ген будет работать по тому варианту, который описывается именно этим аллелем. Важно, что так как у одного гена может быть более двух вариантов (аллелей), то и доминантность аллеля определяется по отношению к каждому из вариантов, хотя есть и те, которые доминантны по сравнению со всеми другими. Встречаются варианты с одинаковой предпочтительностью для работы, тогда проявляется совместное влияние этих вариантов.

Рецессивный аллель – по аналогии с доминантным аллелем, это такое состояние гена, которое наименее предпочтительно для проявления. Поэтому если в геноме есть другая копия гена, доминантная, то задавать темп работы гена будет именно она, но если и вторая копия гена представлена рецессивным аллелем, то будет работать этот, хотя менее предпочтительный, но в такой ситуации единственно имеющийся вариант. Хотя в большинстве случаев связанные с возникновением заболевания аллели рецессивны, это вредность/полезность не является единственным определяющим фактором рецессивности/доминантности аллеля.

Гомозигота. Гомозиготой по определенной мутации/полиморфизму/аллелю называют такую клетку или организм, в генотипе которой/которого обе копии гена на двух хромосомах представлены одним вариантом, то есть не отличаются по этой мутации/полиморфизму/аллелю.

Гетерозигота. Гетерозиготой по определенной мутации/полиморфизму/аллелю называют такую клетку или организм, в генотипе которой/которого две копии гена на двух хромосомах представлены разными вариантами, то есть отличаются по этой мутации/полиморфизму/аллелю.

Секвенирование – это группа методов, позволяющая узнать последовательность нуклеотидов в молекуле ДНК. Этот метод обладает некоторыми особенностями. Во-первых, пока что ни один способ секвенирования не позволяет прочитать всю последовательность одной хромосомы, чтение идет сравнительно небольшими отрезка от 50 до несколько тысяч нуклеотидов. Во-вторых, почти все методы устроены так, что из кусочка ДНК делается много одинаковых и читаются они все. Эта особенность проявляется в таком параметре секвенирования, как глубина секвенирования, обозначаемая 10Х, 20Х, 50Х. Чем больше это значение, тем больше раз прочитан один и тот же кусок молекулы, тем точнее можно выявить ошибки секвенирования и особенности участка, например, его гетерозиготность по какой-либо мутации/полиморфизму.

Гаплотип — совокупность состояний/вариантов определенных локусов, которые расположены на одной хромосоме, и вследствие структурных особенностей эти состояния всегда наследуются вместе. То есть, например, если в одном локусе (1) гаплотипа имеется мутация (1А), а в другом (2) имеется уже другая мутация (2M), то именно в таком составе они будут наследоваться (1А2М), а смешанных вариантов (1B2M или 1A2N) не бывает или они относятся к другому гаплотипу.

Гаплогруппа — совокупность особей, имеющих сходный гаплотип по определенным локусам, которые задаются в соответствии с тем, какую задачу нужно решить, определяя гаплогруппу

Митохондриальная ДНК. Если разбираться подробнее и глубже, то генетическая информация одного человека находится не только в 46 хромосомах, располагающихся в специальном отсеке клетки – ядре, но и в клеточных органах митохондриях. У митохондрий в клетке своя задача – преобразовывать энергию, заключенную в химической связи определенных атомов, в более удобную для клетки, то есть они готовят эффективные питательные запасы из разного сырья. Митохондрии довольно сложны, их оболочка хитро устроена, чтобы опасные побочные продукты готовки не могли попасть в остальную часть клетки, поэтому все время таскать туда нужные для их работы белки не слишком продуктивно. Таким образом, у них есть своя ДНК, которая несет информацию о разных особенных белках и РНК, которые нужны именно для работы митохондрии. Такую ДНК называют митохондриальной и она является неотъемлемой и обязательной частью нашего генотипа. Передается она только от мамы, так как сперматозоид для возможности быстро перемещаться и долго оставаться живым несет самый минимум необходимой генетической информации – 23 хромосомы. А вот яйцеклетка, которой для выполнения основной функции не нужно находится в агрессивной окружающей среде, может позволить себе бОльшую массу и дополнительные запасы в виде готовых к работе станций приготовления питания – митохондрий и заранее синтезированных белков и РНК.

Гены половой дифференцировки – группа генов, играющая ведущую роль в определении будет эмбрион развиваться как девочка или как мальчик. В геноме человека основой проявления мужских или женских половых признаков является наличие/отсутствие половой хромосомы Y, а именно особо локуса этой хромосомы – SRY (Sex-determining Region on the Y chromosome). Важно отметить, что нарушения в этом локусе могут приводить не к внешним проявлениям, а к сниженной репродуктивной способности мужчины или ее полному отсутствию. Процесс дифференцировки пола у человека можно представить тремя стадиями: 1) какой набор хромосом получается при слиянии яйцеклетки (всегда несет хромосому X) и сперматозоида (с хромосомой X или Y), 2) формирование женских или мужских половых органов в зависимости от работы генов локуса SRY, 3) развитие вторичных половых органов в соответствии с типом половых органов. Нарушения на разных этапах приводят к разным проявлениям и разным заболеваниям.

Локус AZF – это участок Y-хромосомы, на котором располагаются так называемые факторы азооспермии (AZF — AZoospermia Factors). Это особые участки, которые названы так, потому что если какой-то из них отсутствует из-за мутации, то развивается азооспермия (отсутствие сперматозоидов) или олигозооспермия (малое количество сперматозоидов). Всего обнаружено три таких фактора AZFa, AZFb и AZFc. В норме наличие всех трех является минимальным необходимым условием нормального формирования сперматозоидов. Если в геноме отсутствует один из AZFa и AZFb или оба, то нарушается созревание сперматозоидов и, как следствие, полностью отсутствует репродуктивная функция. При отсутствии локуса AZFc нарушения могут быть не столь сильными, поэтому деторождение остается возможным в некоторых случаях.

Хромосомные аномалии – это крупные мутации, которые связаны с изменением последовательности ДНК не в рамках отдельного гена или нескольких, а в масштабе хромосомы или генома. Например, отсутствие (делеция) большой части или всей хромосомы, лишняя хромосома, или часть одной хромосомы соединена с частью другой хромосомы и т.д.

Наследственное заболевание – это заболевание, вызванное нарушениями в геноме, то есть мутациями, которые либо мешают формированию нормального белка (так как ген – инструкция по его построению – поврежден), либо изменяют регуляцию, то есть условия, когда, в каком месте или с кем такой белок или ген должен работать.

Моногенное заболевание – это наследственное заболевание, вызванное мутацией в одном только в одном гене. Несмотря на то, что все остальные почти 30000 генов могут быть в порядке, изменение последовательности ДНК в этом гене вызывает нарушения функционирования всего организма.

Хромосомное заболевание – наследственное заболевание, вызванное хромосомными аномалиями.

Носительство мутации – это состояние гетерозиготы по аллелю, обладающему какими-то негативными клиническими проявлениями, если он находится в геноме в виде гомозиготы.

Пробанд – человек, с которого начинается составление генеалогического дерева (родословной). Обычно пробанд – это носитель или пациент с наследственным заболеванием, проявление которого и вызвало необходимость генеалогического анализа.

Сиблинг – в генетике таким термином обозначают потомков одних родителей, то есть братьев и сестер, но не близнецов.

Автор: Жикривецкая Светлана

Биолог-исследователь

ЛОКУС КОНТРОЛЯ КАК ДЕТЕРМИНАНТА АГРЕССИВНОСТИ ПРИ ИНТЕЛЛЕКТУАЛЬНОЙ ОДАРЕННОСТИ ПОДРОСТКОВ | Воронова

1. . 1. Дубровина С. В. Особенности типичных психических состояний у интеллектуально одаренных учащихся // Вестник Бурятского государственного университета. 2011. № 5. С. 203–206.

2. Климонтова Т. А. Психологические механизмы самоорганизации внутреннего мира интеллектуально одаренных старшеклассников // Вестник Московского городского педагогического университета. Серия: Педагогика и психология. 2011. № 3. С. 32–41.

3. Климонтова Т. А. Особенности внутреннего мира и психологические механизмы его становления у интеллектуально одаренных старшеклассников // Психология образования: состояние и перспективы: материалы научно-практической конференции психологов Сибири. Иркутск: ИГУ, 2011. С. 669–673.

4. Вrowder C. S. Metacognitive strategy research: results from a study with young (pre-school) children // K. A. Heller, A. Ziegler (Eds.). Munich studies of giftedness. Berlin: Lit Verlag, 2010. P. 67–84.

5. Климонтова Т. А. Особенности внутреннего мира интеллектуально одаренных подростков // Инновационные проекты и программы в образовании. 2011. № 3. С. 66–69.

6. Чепурко Ю. В. Рельеф психических состояний интеллектуально одаренных учащихся, занимающихся спортом // Личность, интеллект, метакогниции: исследовательские подходы и образовательные практики: материалы II Международной научно-практической конференции. Калужский государственный университет им. К. Э. Циолковского. 2017. С. 570–575.

7. Czerwińska-Jakimiuk E. Przestępczość m łodocianych. Interpretacja zjawiska w świetle ogólnej teorii napięcia Roberta Agnew. Wydaw. Uniwersytetu Pedagogicznego, Kraków, 2011.

8. Clark B. Growing up gifted: developing the potential of children at school and home. Boston: Pearson, 2012. 320 p.

9. Ениколопов С. Н., Кузнецова Ю. М., Чудова Н. В. Когнитивные факторы агрессии и каузальная атрибуция агрессивности // Прикладная юридическая психология. 2011. № 2. С. 43–58.

10. Боравова А. И. Взаимосвязь мотивации успеха и боязни неудачи с агрессивностью и уровнем постоянного потенциала головного мозга у подростков // Фундаментальные проблемы нейронаук. Функциональная асимметрия. Нейропластичность. Нейродегенерация: материалы Всероссийской научной конференции с международным участием / Российская академия наук, ФГБУ «Научный центр неврологии» РАМН, Научный совет РФ по неврологии. 2014. С. 47–55.

11. Попова С. А. Взаимосвязь между агрессивностью и самосознанием личности подростков // Вестник Воронежского института экономики и социального управления. 2014. № 2. С. 51–53.

12. Сазонова В. Н., Люлина Е. И. Взаимосвязь между агрессивностью и самосознанием личности студентов подросткового возраста // Вестник Воронежского института экономики и социального управления. 2013. № 3–4. С. 12–14.

13. Авдулова Т. П. Агрессивность в подростковом возрасте: практическое пособие. Москва, 2017. 147 с.

14. Александрова Л. А., Михайлова В. П., Корытченкова Н. И., Кувшинова Т. И. Связь механизмов психологических защит и совладания (coping) с акцентуациями характера, типом темперамента, эмоциональной компетентностью и агрессивностью // Вестник Кемеровского государственного университета. 2008. № 4 (36). С. 75–83.

15. Головина Е. В. Взаимосвязь уверенности в себе с эмоциональностью и агрессивностью // Прикладная юридическая психология. 2014. № 4. С. 85–92.

16. Гайворонская А. А. Агрессивность и установка альтруизм/эгоизм в юношеском возрасте // Категория «социального» в современной педагогике и психологии: материалы 2-й научно-практической конференции (заочной) с международным участием: в 2 ч. 2014. С. 134–35.

17. Червинская-Якимюк Э. Ф. Взаимосвязь между социальной дезадаптацией, агрессивностью, чувством напряжения и самоэффективностью в группе студентов техникумов // Социодинамика. 2015. № 6. С. 20–38.

18. Franz Mönks en Irene Ypenburg. Hoogbegaafdheid bij kinderen. Uitgeveij Boom, Amsterdam, 2011. 210 с.

19. Czerwińska-Jakimiuk E. Przestępczość m łodocianych w okresie transformacji społeczno-ustrojowej w Polsce: analiza zjawiska w świetle ogólnej teorii napięcia Roberta Agnew, W: Identyfikacja i zarządzanie problemami społecznymi / pod red. Joanny Zameckiej. Warszawa: Instytut Profilaktyki Społecznej i Resocjalizacji Uniwersytetu Warszawskiego, Prace Katedry Socjologii Norm, Dewiacji i Kontroli Społecznej. 2011. t. 12.

20. Шестакова Е. Г., Дорфман Л. Я. Агрессивное поведение и агрессивность личности // Образование и наука. 2009. № 7. С. 51–66.

21. Хван А. А., Зайцев Ю. А., Кузнецова Ю. А. Стандартизация опросника А. Басса и А. Дарки // Психологическая диагностика. 2008. № 1. С. 35–58.

Про внутренний и внешний локус контроля / Авторские статьи / Статьи / Эголюция

Социальный психолог Джулиан Роттерм в 1954 г. ввел понятие – локус контроля. Локус контроля – это то, как человек оценивает свои успехи или неудачи с точки зрения своего влияния на обстоятельства. То есть, если человек видит причины во внешнем мире, приписывает результаты своей деятельности внешним причинам, это называется — внешним локусом контроля. А если он объясняет для себя результаты своей деятельности внутренними характеристиками (свои усилия, положительные и отрицательные качества, наличие или отсутствие необходимых знаний, умений и навыков и т.п.), это называется — внутренним локусом контроля.

Достаточно очевидно, что если мы видим причины во внешних обстоятельствах, то с этими обстоятельствами ничего поделать нельзя. А если мы видим причину в себе, то себя можно менять. В этом смысле внешний локус контроля не дает маневра к изменениям ситуации, а внутренний дает. Люди с внешним локусом контроля – это классические жертвы. Они жертвы разных внешних причин – плохой погоды, плохого начальства, плохого правительства, неинтересной низкооплачиваемой работы, социальной незащищенности, плохих родителей, которые травмировали их в детстве (очень модная тема) и т.д. В отношениях – это жертвы «плохих» партнеров. Претензий очень много: недостаточно любит, не уделяет внимания столько, сколько хотелось бы, не помогает, даже «кофе в постель не носит». Позицию жертвы, конечно, может занимать в отношениях и женщина и мужчина, но поговорим о типичных женских темах.

Часто приходят женщины и возмущаются о поведении своих мужей, партнеров или вообще мужчин. Или жалуются на отсутствие радости и интереса в жизни, на депрессию, объясняя это тем, что партнер не дает им то, что им бы хотелось. Типичные жалобы: я несчастная, потому что он: «Не делает ничего по дому, не занимается ребенком, лежит на диване, не зарабатывает, не разговаривает со мной, оскорбляет, не зовет на свидание, мужчины пошли не те… (жадные, ленивые, вялые и т.д.), мужчин мало, женщин много и т.д». Или: «У меня депрессия, потому что я его люблю… (а он неблагодарный)». Все эти примеры из внешнего локуса контроля. То есть ощущение счастья и хорошего эмоционального фона тесно связывается в сознании с действиями партнера. При этом, чем инфантильнее человек, тем больше и сильнее зависимость.

Очень часто речь пестрит оборотами в пассивном залоге: «Меня обидели, унизили, оскорбили, разочаровали». То есть, как будто с человеком все время что-то делают насильно без участия и его воли.

Ситуация из внешнего локуса выглядит как безвыходная. Из внешнего локуса все сложные жизненные ситуации выглядят как безвыходные. Из внешнего локуса понимание вещей такое: «У меня плохой муж, поэтому я несчастна!», «У меня нет мужа, поэтому я несчастна», «У меня травмы детства, поэтому я неуспешная», «Меня родители не научили, поэтому я не умею строить отношения с противоположным полом». Из внутреннего локуса все будет выглядеть по-другому, например: «Что я могу сделать для себя, чтобы чувствовать себя более счастливой, удовлетворенной, радостной?», «Чем я могу себе помочь?», «Что могу сделать, чтобы доходы мои увеличились?» и т.д. Обычно для людей с внешним локусом контроля такие вопросы вызывают сложности, потому что нет привычки опираться на себя, а есть привычка жаловаться на судьбу.

В первый момент кажется, что ничего нельзя сделать или вложения достаточно серьезные, а отдача не очевидна. Но как только человек начинает менять что-либо в себе, например, идет учиться чему-то новому, начинает просто ходить на прогулку, делать зарядку, прекращает пилить партнера со своими требованиями, ситуация начинает потихоньку меняться. Важно отслеживать промежуточные результаты. И самое ценное в этих действиях то, что сам человек проявил волю, сделал что-то сам и получил результат. То есть этот результат появился благодаря деятельности (желанию, воли и действиям) самого человека. И осознание этого приносит ощущение «Я могу», что и растит внутренний локус контроля.

Анна Матвеева- практикующий психолог, психодраматерапевт. Записаться к Анне на консультацию можно через форму на главной странице или по телефону +7 (916) 446-34-31

Вам может быть интересно

Контактная импровизация – вид танцевально-двигательной активности, когда партнеры, находясь в соприкосновении, отдают часть своего веса друг другу, играя силами гравитации, инерции, импульсов тела, позволяют точке физического контакта свободно перемещаться в пространстве их тел.

Читать дальше

В раннем возрасте интенсивно развивается потребность к новым впечатлениям. Приучать малыша выполнять действия, связанные с нахождением предметов и игрушек, одинаковых формой и величиной, упражняться в ориентировании на собственном теле показать глаза, нос, уши, волосы.

Читать дальше

Взаимосвязи между физическими данными и психологическими особенностями человека позволяют по одному взгляду многое сказать о собеседнике или даже о незнакомом человеке.

Читать дальше

Локус контроля — Психологос

Джулиан Роттер

Локус контроля — склонность приписывать свои успехи или неудачи внутренним либо внешним факторам.

Введено социальным психологом Джулианом Роттером в 1954 году.

Склонность приписывать результаты деятельности внешним факторам — внешний локус контроля. Человек с такой склонностью — Экстернальный тип.

Склонность приписывать результаты деятельности внутренним факторам — внутренний локус контроля, человек с такой привычкой — Интернальный тип.

Внутренними факторами здесь являются: свои усилия, собственные положительные и отрицательные качества, наличие или отсутствие необходимый знаний, умений и навыков, и т. п. .

«Локус контроля» называют также «локализацией контроля волевого усилия»

Например, если ученик получил неудовлетворительную оценку, то обладая внешней локализацией контроля он возложит вину на внешние факторы (например «к родителям пришли гости и отвлекали меня от выполнения домашнего задания», «задание было плохо написано на доске» и т. п.), а обладая внутренней — на внутренние (например «я не успел должным образом подготовиться к предмету», «я так и не смог найти решение задачи» и т. п.)

Для определения локуса контроля используется опросник Роттера.

Как вырабатывать внутренний локус-контроль?

В первую очередь — выходить из позиции Жертвы.

Позиция Жертвы и внешний локус контроля (экстернальный тип личности) — понятия очень близкие, но не идентичные. Человек с позицией Жертвы очень похож на экстернальный тип личности, когда человек убежден, что его успехи и неудачи зависят прежде всего от внешних обстоятельств – условий окружающей среды, действий других людей, случайности, везения или невезения и т. д. Однако экстернальный тип свои успехи и удачи относит только на счет внешних факторов, человек в позиции Жертвы свои успехи может приписывать себе.

Genomia: Тестирование собак: Locus D (Dilution)

ДНК-тест однозначно выявляет аллели  D, d1

Ген MLPH (melanophilin gene) отвечает за ослабление темного пигмента эумеланина, когда исходный черный окрас изменяется на синий (серый) или исходный коричневый окрас (печеночный) изменяется на лиловый. До сих пор было идентифицировано три варианта MLPH гена), причем каждый из них тестируется отдельно:

• аллель d1: вариант c.-22G>A гена MLPH – наиболее распространенный, проявляется у многих пород

• аллель d2: вариант c.705G>C гена MLPH – проявляется у пород чау чау, арабская борзая, тайский риджбек, французский карликовый бульдог – у данных пород может иметь место сочетание аллелей d1/d2 – у данных собак будет присутствовать разбавление окраса шерсти → заказ двойного теста локуса D (аллели d1 + d2) можно оформить здесь.

• аллель d3: вариант c.667_668insC MLPH genu – проявляется у пород чивава, венгерский муди, венгерский пуми, итальянская борзая, пекинская собака, шотландская овчарка, шитцу, тибетская дога, йоркширский терьер – у данных пород может иметь место сочетание аллелей d1/d3 – у данных собак будет присутствовать разбавление окраса шерсти → заказ двойного теста локуса D (аллели d1 + d3) можно оформить здесь.

Каждый из вариантов имеет рецессивную наследственность – для того, чтобы разбавление окраса проявилось, животное должно унаследовать аллель разбавления окраса от обоих родителей.

По всей вероятности, со временем будут обнаружены прочие генные варианты, приводящие к разбавлению окраса, так имеются породы с разбавлением окраса, которое не вызвано аллелями d1, d2 и d3.

.

Reference:

Van Buren, S.L., Minor, K.M., Grahn, R.A., Mickelson, J.R., Grahn, J.C., Malvick, J., Colangelo, J.R., Mueller, E., Kuehnlein, P., Kehl, A. : A Third MLPH Variant Causing Coat Color Dilution in Dogs. Genes (Basel) 11:, 2020. Pubmed reference: 32531980.

Bauer, A., Kehl, A., Jagannathan, V., Leeb, T. : A novel MLPH variant in dogs with coat colour dilution. Anim Genet 49:94-97, 2018. Pubmed reference: 29349785.

Drögemüller, C., Philipp, U., Haase, B., Günzel-Apel, A.R., Leeb, T. : A noncoding melanophilin gene (MLPH) SNP at the splice donor of exon 1 represents a candidate causal mutation for coat color dilution in dogs. J Hered 98:468-73, 2007. Pubmed reference: 17519392.

Определение локуса по Merriam-Webster

lo · cus | \ ˈLō-kəs \ множественное число \ ˈLō- ˌsī , — kī, — kē \

формальный : центральное или главное место, где что-то происходит или обнаруживается Область стала очагом сопротивления правительству.

1а : место, где что-то находится или происходит : участок, местонахождение была ли медицинская культура вначале рассредоточенной из одного очага или она возникла в нескольких локусах ? — S.К. Харви

б : центр активности, внимания или концентрации в демократии центр власти находится в людях — Х. Г. Риковер

2 : набор всех точек, расположение которых определяется указанными условиями.

Что такое функциональный локус? Понимание генетической основы сложных фенотипических признаков

Med Hypotheses.Авторская рукопись; доступно в PMC 2012 1 мая.

Опубликован в окончательной отредактированной форме как:

PMCID: PMC3076543

NIHMSID: NIHMS265041

Центр эпидемиологии слайдов при Бостонском университете, Бостон, Департамент эпидемиологии общественного здравоохранения Бостонского университета. , Бостон, Массачусетс

Автор, ответственный за переписку: Эдвард А. Руис-Нарваэс Эпидемиологический центр Бостонского университета 1010 Commonwealth Avenue Бостон, Массачусетс, США 02215, США Тел. 617-734-6006, факс 617-738-5119 ude.ub @ ranziure Окончательная отредактированная версия этой статьи издателем доступна на Med Hypotheses См. другие статьи в PMC, в которых цитируется опубликованная статья.

Abstract

В последние годы было опубликовано множество результатов полногеномных ассоциативных исследований в отношении различных заболеваний и фенотипических признаков человека. Однако выявленные полиморфизмы объясняют лишь небольшую часть изменчивости признаков и являются плохими предикторами возникновения заболевания. Хотя часть отсутствующей изменчивости может быть обнаружена в еще не идентифицированных редких генетических вариантах, настоящая работа предполагает, что основная часть проблемы связана с нашими концептуальными ограничениями в отношении функциональных локусов и их вариантов.Функциональные варианты в настоящее время определены в абсолютных позиционных терминах; они просто вариации последовательности в фиксированных положениях вдоль молекулы ДНК. В настоящем исследовании постулируется, что функциональные локусы могут включать различные положения в последовательности ДНК. Как следствие, варианты одного и того же функционального локуса могут располагаться в разных физических положениях вдоль генома, и наблюдаемый эффект любого конкретного генетического варианта затем будет снижен по сравнению с его истинным эффектом. Дифференциальное использование регуляторных областей, таких как промоторы и энхансеры генов, было бы частным случаем предложенной гипотезы.Гипотеза делает предсказания, которые можно проверить, предлагая потенциальные пути исследования для выяснения генетической основы сложных человеческих черт.

Ключевые слова: Эпигенетика, GWAS, отсутствие наследственности, экспрессия генов, болезнь человека

ВВЕДЕНИЕ

Основное предположение при изучении того, как генетические вариации могут влиять на вариабельность фенотипических признаков человека, состоит в том, что функциональные варианты соответствуют физическим вариантам и их положениям фиксируются вдоль ДНК.Например, текущий подход к идентификации функциональных локусов — это использование полногеномных ассоциативных исследований (GWAS), в которых сотни тысяч физических вариантов (однонуклеотидные полиморфизмы, SNP) в геноме генотипируются и сравниваются между тысячами субъектов для оценить связь с изучаемым фенотипическим признаком (например, заболеванием) (). Поскольку предполагается, что функциональные локусы имеют фиксированные положения, различия частот аллелей между случаями и контролями проверяются в рамках каждого генетического полиморфизма.Таким образом, генотипируя сотни тысяч физических локусов, мы могли бы идентифицировать подмножество функциональных вариантов (или, по крайней мере, вариантов, которые находятся в неравновесном сцеплении с функциональными), которые определяют любой фенотипический признак.

Полногеномное исследование ассоциации

Сотни тысяч однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) генотипируются в случаях заболевания и контроле для оценки связи с конкретным заболеванием. Различия в частотах аллелей между случаями и контролем проверяются для каждого генетического полиморфизма.В этом примере первый и пятый полиморфизмы слева направо (в овалах) показывают различия между случаями и контролями: генетический вариант (закрашенные кружки) чаще встречается в случаях по сравнению с контролем.

В настоящей работе я предполагаю, что, вопреки текущим предположениям, положения функциональных локусов не фиксируются в последовательности ДНК; один конкретный функциональный локус может охватывать разные физические локусы.

ПРОБЛЕМА

За последние несколько лет было завершено и опубликовано большое количество GWAS по различным человеческим заболеваниям и фенотипическим признакам, включая рак [1-3], психические заболевания [4, 5], диабет 2 типа [ 6-8], вес [9-11] и рост [12-14] среди других.Хотя GWAS обладают потенциалом для выявления генетических вариантов, связанных с новыми механизмами заболевания, результаты, похоже, пока не объясняют большую часть общей фенотипической изменчивости из-за генетических факторов. Например, идентифицированные генетические варианты, связанные с массой тела, объясняют только около 1% от общей ожидаемой генетической изменчивости [15], 18 идентифицированных локусов связаны с относительным риском братьев и сестер всего 1,07 (т. Е. Увеличение риска заболевания на 7% по сравнению с общий популяционный риск) диабета 2 типа [16], и 40 недавно идентифицированных локусов объясняют примерно 5% фенотипической изменчивости роста [12-14].Как следствие, идентифицированные генетические варианты также являются плохими предикторами возникновения заболевания. Для диабета 2 типа оценка генотипа 18 идентифицированных однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) не дает дополнительных возможностей для прогнозирования, если принять во внимание известные факторы риска (например, возраст, семейный анамнез, вес и т. Д.) [16, 17] . Наконец, недавнее исследование показало, что добавление 10 общих генетических вариантов, связанных с раком груди, к модели риска, содержащей репродуктивный, медицинский и семейный анамнез, не дало дополнительной информации о риске развития рака груди [18].

Частично проблема может быть связана с техническими ограничениями текущих платформ GWAS, которые не могут улавливать редкие варианты, способствующие изменчивости фенотипических признаков [19, 20]. Текущие усилия, такие как проект «1000 геномов», помогут идентифицировать и каталогизировать редкие варианты для использования в будущем GWAS. Другие типы генетических факторов, такие как варианты числа копий (CNV), также могут вносить вклад в генетическую основу человеческих черт. Однако я утверждаю, что основная часть проблемы связана с нашими текущими ограничениями в отношении концепции функциональных вариантов.Как показано, функциональные варианты в настоящее время определяются в терминах абсолютного положения или, другими словами, они просто рассматриваются как вариации последовательности в одном и том же положении вдоль ДНК. Таким образом, сравниваются частоты аллелей в пределах каждого генетического полиморфизма, чтобы оценить, коррелируют ли конкретные генетические варианты с изучаемым фенотипическим признаком.

ГИПОТЕЗА

Я постулирую, что функциональные локусы не имеют фиксированных положений вдоль последовательности ДНК. Как следствие, варианты одного и того же функционального локуса могут располагаться в разных физических положениях в геноме.Один пример поможет прояснить смысл и значимость выдвинутой гипотезы. Африканский трипаносома Trypanosoma brucei — одноклеточное простейшее, которое поражает кровоток млекопитающих и вызывает сонную болезнь у людей. T. brucei способен ускользать от иммунной системы хозяина, периодически меняя свою защитную оболочку, вариантный поверхностный гликопротеин (VSG) (см. Обзор в [21, 22]). T. brucei имеет более 1000 генов VSG , но только один транскрибируется в данный момент времени со скоростью переключения около 1% на клетку трипаносомы на поколение [23].Как показывает этот пример, мы можем рассматривать весь набор из генов VSG как единый функциональный локус и, следовательно, его функциональные варианты могут располагаться в разных положениях вдоль генома T. brucei . Как ясно видно, положение функциональных вариантов не является фиксированным, а зависит от того, какой ген VSG экспрессируется у конкретного трипаносомного паразита.

VSG генов в Tripanosome brucei

Геном паразита T.brucei имеет более 1000 генов VSG , и только один ген (закрашенные прямоугольники) экспрессируется в данный момент времени. В среднем, генетический паттерн экспрессии (то есть, какой ген VSG транскрибируется) будет передаваться через ~ 100 поколений T. brucei до переключения транскрипции. Поскольку разные паразиты T. brucei могут экспрессировать разные гены VSG , отнесение функциональных локусов к фиксированным геномным положениям не имеет функционального смысла.

Из последнего примера мы можем определить функциональный локус как весь набор геномных областей, которые альтернативно используются для выполнения той же функции. Регуляторные области также могут быть примером различных областей ДНК, принадлежащих к одному и тому же функциональному локусу. Различные элементы, такие как промоторы и энхансеры, регулируют экспрессию генов, и данный ген может находиться под действием множества таких регуляторных элементов. Например, более половины генов человека имеют альтернативные промоторы [24], в среднем 3.1 промоторов на ген [25], и несколько энхансеров могут регулировать экспрессию одного и того же гена [26-28]. Для правильной экспрессии генов, специфичных для тканей и развития, необходимо использование множества регуляторных элементов, но это также открывает возможность того, что индивидуальные различия в экспрессии генов опосредуются альтернативным использованием регуляторных элементов. Я предлагаю гипотезу о том, что существует наследственная тенденция к предпочтительному использованию определенных регулирующих элементов, а не других. Между людьми, у которых используется регулирующий элемент, будут различия, и такие различия будут передаваться по наследству.Использование альтернативных регуляторных элементов могло бы быть частным случаем более общей гипотезы о принадлежности различных участков генома к одному и тому же функциональному локусу.

ПРОСТАЯ МОДЕЛЬ

Дайте нам знать, рассмотрим простую модель, которая может помочь нам понять, почему генетические варианты, обнаруженные до сих пор с помощью GWAS, являются плохими предикторами заболевания. Для простоты в модели предполагается ген с двумя альтернативными промоторами P1 и P2 (), хотя модель может быть обобщена на более чем два промотора, а в модель также могут быть добавлены другие регуляторные элементы.Модель предполагает наличие различий между субъектами, в которых используется промоутер; некоторые люди будут использовать промотор P1, а другие будут использовать промотор P2. Выбор промотора может зависеть от эпигенетических механизмов, таких как метилирование остатков цитозина в ДНК. Генетический полиморфизм G1 с аллелями A1 и A2 расположен внутри промотора P1; аллель A1 увеличивает риск заболевания по сравнению с аллелем A2 . Другой генетический полиморфизм G2 с аллелями B1 и B2 расположен в промоторе P2; Аллель B1 увеличивает риск заболевания по сравнению с аллелем B2 .

Ген с двумя альтернативными промоторами

Ген X может транскрибироваться с двух разных альтернативных промоторов P1 и P2. Предполагается существование индивидуальных вариаций того, какой из промоторов используется. Полиморфизм G1 расположен внутри промотора P1, а другой полиморфизм G2 расположен внутри промотора P2.

Поскольку текущие исследования генетических ассоциаций предполагают, что функциональные варианты имеют фиксированное положение, мы исследуем, как это предположение может привести к недооценке генетических эффектов.Предположим, мы провели исследование генетической ассоциации, чтобы изучить взаимосвязь между генетическими полиморфизмами G1 и G2 с риском заболевания. Исходя из современного мышления, мы будем рассматривать оба генетических полиморфизма как разные функциональные локусы. Также мы не знаем о различном использовании промоторов P1 и P2 у разных людей. Как показано, связь между полиморфизмом G1 и риском заболевания (т. Е. Аллель A1 , связанный с более высоким риском заболевания, и аллель A2 , связанный с более низким риском заболевания) присутствует только при использовании промотора P1 (хромосома типы от 1 до 4 дюймов).Поскольку мы не знаем, какой промотор используется, мы не можем измерить истинную связь между полиморфизмом G1 и риском заболевания; наблюдаемая связь между полиморфизмом G1 и риском заболевания будет разбавлена ​​наличием хромосом, в которых используется промотор P2. Такая же ситуация произойдет с полиморфизмом G2, учитывая тот факт, что его связь с риском заболевания (т. Е. Аллель B1 , связанный с более высоким риском заболевания, и аллель B2 , связанный с более низким риском заболевания) присутствует только тогда, когда Используется промотор P2 (типы хромосом с 5 по 8 дюйма).Наблюдаемая связь между G2 и риском заболевания будет разбавлена ​​наличием хромосом, в которых используется промотор P1.

Таблица 1

Риск заболевания в зависимости от типа хромосомы

Хромосома типа	Используемый промотор	Полиморфизм G1	Полиморфизм G2
			P1	A1	B1	Высокий
2	P1	A1	B2	Высокий
3	P1 901 901 901	901 901 901 901 901 9016	P1	A2	B2	Низкий
5	P2	A1	B1	Высокий
6	B2	901 901 901 B2 901 7	P2	A2	B1	Высокий
8	P2	A2	B2	Низкий

Чтобы по-настоящему понять генетическую основу заболевания, обсуждаемого в последнем примере, нам нужно знать, какой из промоторов используется, и мы должны учитывать оба генетических полиморфизма, G1 и G2, как принадлежащий к тому же функциональному локусу.Среди субъектов с обеими гомологичными хромосомами, использующими промотор P1, релевантным полиморфизмом является G1; среди субъектов с обеими гомологичными хромосомами, использующими промотор P2, релевантным полиморфизмом является G2; и для людей, использующих оба промотора, нам необходимо определить новый генотип, состоящий из одного аллеля полиморфизма G1 (от хромосомы с использованием промотора P1) и одного аллеля полиморфизма G2 (от хромосомы с использованием промотора P2).

БИОЛОГИЧЕСКАЯ ДОСТУПНОСТЬ ЭПИГЕНЕТИЧЕСКОЙ МОДЕЛИ

Настоящая работа предполагает, что функциональные локусы не имеют фиксированных позиций вдоль генома.Как обсуждалось в примере, касающемся альтернативного использования генов VSG в T. brucei , разные физические (то есть генетические) локусы могут быть частью одного и того же функционального локуса. Альтернативные промоторы того же гена у млекопитающих дают возможность искать эмпирические доказательства предложенной гипотезы. Известно, что значительная часть генов человека имеет несколько промоторов [24, 25], и использование этих альтернативных промоторов имеет тенденцию быть тканеспецифичным [29-32]. Тем не менее, нет крупномасштабных исследований в человеческих популяциях для оценки межличностных вариаций в использовании этих альтернативных промоторов.Это исследование постулирует, что существуют индивидуальные различия в использовании альтернативных промоторов, и такие вариации могут быть унаследованы, по крайней мере частично, через эпигенетические механизмы, такие как метилирование ДНК. Примечательно, что недавнее исследование с участием двадцати шести здоровых субъектов показало, что пять из семи альтернативных промоторов гена глюкокортикоидного рецептора (GR) показали высокую межиндивидуальную вариабельность паттернов метилирования [33], и есть доказательства того, что метилирование играет ключевую роль. роль в использовании альтернативных промоторов [34-37].

ТОГДА, ЧТО ТАКОЕ АЛЛЕЛЕ?

Предлагаемая гипотеза проливает новый свет на концепции гена и аллеля . Как было широко отмечено [38-40], наше понимание того, что такое ген, эволюционировало с течением времени из-за наших растущих знаний о молекулярной биологии ДНК и РНК. Независимо от определения гена, предложенного разными авторами [38-40], ясно, что последовательности ДНК самой по себе недостаточно, чтобы решить, что такое ген, и любое значимое определение гена должно каким-то образом включать ссылку на механизмы экспрессии.Поэтому вызывает беспокойство то обстоятельство, что, хотя современная концепция гена включает в себя нечто большее, чем последовательность ДНК, аллель по-прежнему определяется в основном в позиционных терминах; однонуклеотидный полиморфизм (SNP), представляющий квинтэссенцию аллеля. Предлагаемая гипотеза предполагает, что определение аллеля только с точки зрения физической вариации ДНК без учета паттернов экспрессии (например, альтернативного использования промоторов) может быть недостаточным для понимания всего спектра наследственной изменчивости.В частности, генетические полиморфизмы в разных физических положениях могут быть функциональными вариантами одного и того же паттерна экспрессии, и в некоторых случаях один и тот же генетический полиморфизм может не быть эквивалентом при сравнении различных субъектов в отношении фенотипического признака. Гипотеза имеет большое значение при подборе моделей риска с использованием генетических полиморфизмов. Недавние исследования показали, что добавление полиморфизмов, идентифицированных GWAS, к моделям риска диабета 2 типа [16, 17] и рака груди [18] не значительно улучшает прогнозирование риска, когда принимаются во внимание известные негенетические факторы риска.Хотя такие результаты могут частично объясняться небольшим эффектом каждого индивидуального полиморфизма, предлагаемая гипотеза предполагает, что при наличии межиндивидуальных вариаций паттернов экспрессии мы можем классифицировать субъектов на основе неправильных генотипов.

Следует отметить, что та же самая структура альтернативных промоторов может использоваться для других типов альтернативных регуляторных областей (например, энхансеров), влияющих на экспрессию генов-мишеней (). Было обнаружено, что область размером ~ 500 т.п.н. на хромосоме 8q24 несет генетические варианты, связанные с различными типами рака, такими как рак простаты, груди, колоректального рака, яичников и мочевого пузыря [1, 41-45].Примечательно, что несколько полиморфизмов, идентифицированных в хромосоме 8q24, распределены в дискретных регионах, которые связаны с определенными типами рака [44]. Эти области имеют тенденцию перекрываться или располагаться рядом с предполагаемыми энхансерами, идентифицированными с помощью биоинформатического анализа и исследований in vitro [46, 47], и по крайней мере один из этих энхансеров способен физически взаимодействовать с промотором гена Myc , расположенного более 300 кб далеко [47]. Остается определить активность in vivo этих различных энхансеров и существуют ли индивидуальные различия в использовании энхансеров.

Ген регулируется альтернативными энхансерами

Ген X регулируется альтернативными энхансерами, пронумерованными от 1 до 4. Гипотеза предполагает, что существует наследственная изменчивость от человека к человеку (опосредованная, по крайней мере, частично посредством эпигенетических механизмов) при использовании альтернативных энхансеров. В области генной пустыни в хромосоме 8q24 было обнаружено множество потенциальных энхансеров, которые несут полиморфизмы, связанные с различными типами рака.

Таким образом, предлагается гипотеза, которая может частично объяснить, почему в настоящее время генетические варианты, идентифицированные GWAS, являются плохими предикторами сложных человеческих черт.Гипотеза делает серию предсказаний, которые можно проверить, и показывает новые пути исследования для оценки взаимосвязи между генетическими вариантами и индивидуальными паттернами экспрессии.

БЛАГОДАРНОСТИ

Автор хотел бы поблагодарить Джули Р. Палмер, Линн Розенберг и Хорхе Азофейфа за их полезные комментарии к рукописи. Эта работа была поддержана грантами R01CA058420 и R01CA098663 Национального института рака, Отдел контроля рака и популяционных исследований (http: // www.racecontrol.cancer.gov).

Сноски

Заявление издателя: Это PDF-файл неотредактированной рукописи, принятой к публикации. В качестве услуги для наших клиентов мы предоставляем эту раннюю версию рукописи. Рукопись будет подвергнута копированию, верстке и рассмотрению полученного доказательства, прежде чем она будет опубликована в окончательной форме для цитирования. Обратите внимание, что во время производственного процесса могут быть обнаружены ошибки, которые могут повлиять на содержание, и все юридические оговорки, относящиеся к журналу, имеют отношение.

КОНФЛИКТ ИНТЕРЕСОВ

Автор заявляет об отсутствии конфликта интересов.

СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ

1. Истон Д.Ф., Пули К.А., Даннинг А.М., Фароа П.Д., Томпсон Д., Баллинджер Д.Г. и др. Полногеномное ассоциативное исследование выявляет новые локусы восприимчивости к раку груди. Природа. 2007; 447: 1087–1093. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 2. Илес Р.А., Котэ-Джараи З., Джайлз Г.Г., Олама А.А., Гай М., Джугурнаут С.К. и др. Множественные недавно идентифицированные локусы, связанные с предрасположенностью к раку простаты.Нат Жене. 2008. 40: 316–321. [PubMed] [Google Scholar] 3. Hung RJ, McKay JD, Gaborieau V, Boffetta P, Hashibe M, Zaridze D, et al. Локус восприимчивости к раку легких отображается на гены субъединиц никотинового ацетилхолинового рецептора на 15q25. Природа. 2008; 452: 633–637. [PubMed] [Google Scholar] 4. Феррейра М.А., О’Донован М.С., Мэн Я.А., Джонс И.Р., Рудерфер Д.М., Джонс Л. и др. Совместный анализ ассоциаций по всему геному подтверждает роль ANK3 и CACNA1C в биполярном расстройстве. Нат Жене. 2008. 40: 1056–1058. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 5.О’Донован М.С., Крэддок Н., Нортон Н., Уильямс Х., Пирс Т., Москвина В. и др. Идентификация локусов, связанных с шизофренией, путем ассоциации по всему геному и последующего наблюдения. Нат Жене. 2008. 40: 1053–1055. [PubMed] [Google Scholar] 6. Sladek R, Rocheleau G, Rung J, Dina C, Shen L, Serre D и др. Полногеномное ассоциативное исследование выявляет новые локусы риска диабета 2 типа. Природа. 2007. 445: 881–885. [PubMed] [Google Scholar] 7. Саксена Р., Войт Б.Ф., Лиссенко В., Бертт Н.П., де Баккер П.И., Чен Х. и др.Полногеномный ассоциативный анализ определяет локусы диабета 2 типа и уровни триглицеридов. Наука. 2007; 316: 1331–1336. [PubMed] [Google Scholar] 8. Скотт Л.Дж., Молке К.Л., Бонникасл Л.Л., Виллер С.Дж., Ли Й., Дурен В.Л. и др. Полногеномное ассоциативное исследование диабета 2 типа у финнов выявило множественные варианты восприимчивости. Наука. 2007; 316: 1341–1345. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 9. Скутери А., Санна С., Чен В. М., Уда М., Альбай Г., Пролив Дж. И др. Полногеномное ассоциативное сканирование показывает, что генетические варианты в гене FTO связаны с признаками, связанными с ожирением.PLoS Genet. 2007; 3: e115. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 10. Thorleifsson G, Walters GB, Gudbjartsson DF, Steinthorsdottir V, Sulem P, Helgadottir A, et al. Полногеномная ассоциация дает новые варианты последовательностей в семи локусах, которые связаны с показателями ожирения. Нат Жене. 2009; 41: 18–24. [PubMed] [Google Scholar] 11. Виллер CJ, Speliotes EK, Loos RJ, Li S, Lindgren CM, Heid IM, et al. Шесть новых локусов, связанных с индексом массы тела, подчеркивают влияние нейронов на регуляцию массы тела.Нат Жене. 2009. 41: 25–34. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 12. Weedon MN, Lango H, Lindgren CM, Wallace C, Evans DM, Mangino M и др. Полногеномный ассоциативный анализ определяет 20 локусов, которые влияют на рост взрослого человека. Нат Жене. 2008. 40: 575–583. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 13. Lettre G, Jackson AU, Gieger C, Schumacher FR, Berndt SI, Sanna S и др. Идентификация десяти локусов, связанных с ростом, указывает на новые биологические пути роста человека. Нат Жене. 2008. 40: 584–591.[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 14. Gudbjartsson DF, Walters GB, Thorleifsson G, Stefansson H, Halldorsson BV, Zusmanovich P, et al. Множество вариантов последовательности, влияющих на разнообразие роста взрослого человека. Нат Жене. 2008. 40: 609–615. [PubMed] [Google Scholar] 15. Хофкер М., Вейменга С. Большой список генов ожирения. Нат Жене. 2009. 41: 139–140. [PubMed] [Google Scholar] 16. Ланго Х., Палмер С.Н., Моррис А.Д., Зеггини Э., Хаттерсли А.Т., Маккарти М.И. и др. Оценка совокупного воздействия 18 распространенных генетических вариантов с умеренным эффектом на риск диабета 2 типа.Диабет. 2008. 57: 3129–3135. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 17. Meigs JB, Shrader P, Sullivan LM, McAteer JB, Fox CS, Dupuis J, et al. Оценка генотипа в дополнение к общим факторам риска для прогнозирования диабета 2 типа. N Engl J Med. 2008; 359: 2208–2219. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 18. Wacholder S, Hartge P, Prentice R, Garcia-Closas M, Feigelson HS, Diver WR, et al. Показатели общих генетических вариантов в моделях риска рака груди. N Engl J Med. 2010; 362: 986–993.[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 20. Маккарти М.И., Хиршхорн Дж. Н. Полногеномные исследования ассоциаций: возможные следующие шаги на генетическом пути. Hum Mol Genet. 2008; 17: R156–165. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 21. Тейлор Дж. Э., Руденко Г. Смена куртки из трипаносом: что в гардеробе? Тенденции Genet. 2006; 22: 614–620. [PubMed] [Google Scholar] 22. Платит Е. Регулирование экспрессии гена антигена у Trypanosoma brucei. Trends Parasitol. 2005; 21: 517–520. [PubMed] [Google Scholar] 23.Тернер CM, Барри JD. Высокая частота антигенных вариаций при инфекциях Trypanosoma brucei rhodesiense. Паразитология. 1989; 99 Pt 1: 67–75. [PubMed] [Google Scholar] 24. Цуритани К., Ирие Т., Ямасита Р., Сакакибара Ю., Вакагури Х., Канаи А. и др. Особый класс предполагаемых «неконсервативных» промоторов у людей: сравнительные исследования альтернативных промоторов генов человека и мыши. Genome Res. 2007. 17: 1005–1014. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 25. Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю., Ота Т., Нисикава Т., Ямасита Р. и др.Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека. Genome Res. 2006; 16: 55–65. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 26. Ким С., Ямадзаки М., Зелла Л.А., Мейер МБ, Фретц Дж.А., Шевде Н.К. и др. Множественные энхансерные области, расположенные на значительных расстояниях перед сайтом старта транскрипции, опосредуют экспрессию гена RANKL в ответ на 1,25-дигидроксивитамин D3. J Стероид Biochem Mol Biol. 2007. 103: 430–434.[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 27. Отт CJ, Blackledge NP, Kerschner JL, Leir SH, Crawford GE, Cotton CU и др. Интронные энхансеры координируют эпителиально-специфическое образование петель активного локуса CFTR. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2009; 106: 19934–19939. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 28. Зелла Л.А., Мейер МБ, Неренц Р.Д., Ли С.М., Мартович М.Л., Пайк Дж.В. Многофункциональные энхансеры регулируют транскрипцию генов рецепторов витамина D мыши и человека. Мол Эндокринол. 2010. 24: 128–147. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 29.Fajas L, Auboeuf D, Raspe E, Schoonjans K, Lefebvre AM, Saladin R, et al. Организация, анализ промотора и экспрессия гена PPARgamma человека. J Biol Chem. 1997; 272: 18779–18789. [PubMed] [Google Scholar] 30. Булун С.Е., Розенталь И.М., Броди А.М., Инкстер С.Е., Зеллер В.П., ДиДжордж А.М. и др. Использование тканеспецифических промоторов в регуляции экспрессии гена ароматазы цитохрома P450 в опухолях полового канатика яичка и яичника человека, а также в нормальных половых железах плода и взрослого человека. J Clin Endocrinol Metab.1993; 77: 1616–1621. [PubMed] [Google Scholar] 31. Эстербауэр Х., Оберкофлер Х., Кремплер Ф., Стросберг А.Д., Патч В. Ген разобщающего белка-3 транскрибируется с тканеспецифичных промоторов у людей, но не у грызунов. J Biol Chem. 2000; 275: 36394–36399. [PubMed] [Google Scholar] 32. Neuhaus IM, Bone L, Wang S, Ionasescu V, Werner R. Ген коннексина 32 человека транскрибируется с двух тканеспецифичных промоторов. Biosci Rep. 1996; 16: 239–248. [PubMed] [Google Scholar] 33. Тернер Дж. Д., Пелашини Л. П., Маседо Дж. А., Мюллер С. П..Сильно индивидуальные паттерны метилирования альтернативных промоторов глюкокортикоидных рецепторов предполагают индивидуализированные эпигенетические регуляторные механизмы. Nucleic Acids Res. 2008. 36: 7207–7218. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 34. Cheong J, Yamada Y, Yamashita R, Irie T., Kanai A, Wakaguri H, et al. Разнообразные статусы метилирования ДНК у альтернативных промоторов генов человека в различных тканях. ДНК Res. 2006. 13: 155–167. [PubMed] [Google Scholar] 35. Арчи В.Б., Сладкий член парламента, Элиг Г.С., Аррик Б.А. Метилирование CpG как детерминанта активации транскрипции на альтернативных промоторах трансформации фактора роста-бета3.Cancer Res. 1999; 59: 2292–2296. [PubMed] [Google Scholar] 36. Дамманн Р., Ли С., Юн Дж. Х., Чин П.Л., Бейтс С., Пфайфер Г.П. Эпигенетическая инактивация белка семейства ассоциативных доменов RAS из локуса-супрессора опухоли легкого 3p21.3. Нат Жене. 2000. 25: 315–319. [PubMed] [Google Scholar] 37. Вентура А., Лузи Л., Пачини С., Балдари К. Т., Пеличчи П. Г.. Ген долголетия p66Shc подавляется посредством эпигенетических модификаций альтернативного промотора. J Biol Chem. 2002; 277: 22370–22376. [PubMed] [Google Scholar] 38.Герштейн М.Б., Брюс С., Розовски Дж. С., Чжэн Д., Ду Дж., Корбель Дж. О. и др. Что такое ген пост-ENCODE? История и обновленное определение. Genome Res. 2007. 17: 669–681. [PubMed] [Google Scholar] 39. Gingeras TR. Происхождение фенотипов: гены и транскрипты. Genome Res. 2007. 17: 682–690. [PubMed] [Google Scholar] 40. Песоле Г. Что такое ген? Обновленное рабочее определение. Ген. 2008; 417: 1–4. [PubMed] [Google Scholar] 41. Амундадоттир Л.Т., Сулем П., Гудмундссон Дж., Хельгасон А., Бейкер А., Агнарссон Б.А. и др. Распространенный вариант, связанный с раком простаты в европейских и африканских популяциях.Нат Жене. 2006; 38: 652–658. [PubMed] [Google Scholar] 42. Gudmundsson J, Sulem P, Manolescu A, Amundadottir LT, Gudbjartsson D, Helgason A, et al. Полногеномное ассоциативное исследование идентифицирует второй вариант предрасположенности к раку простаты на 8q24. Нат Жене. 2007. 39: 631–637. [PubMed] [Google Scholar] 43. Томлинсон I, Уэбб Э., Карвахаль-Кармона Л., Бродерик П., Кемп З., Испания С. и др. Полногеномное сканирование ассоциаций tag SNPs идентифицирует вариант восприимчивости к колоректальному раку на 8q24.21. Нат Жене.2007; 39: 984–988. [PubMed] [Google Scholar] 44. Гоуссайни М., Сонг Х., Кесслер Т., Аль Олама А.А., Котэ-Джарай З., Драйвер К.Е. и др. Множественные локусы с различной специфичностью рака в пустыне гена 8q24. J Natl Cancer Inst. 2008; 100: 962–966. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 45. Wokolorczyk D, Gliniewicz B, Sikorski A, Zlowocka E, Masojc B, Debniak T, et al. Ряд раковых заболеваний связан с маркером rs6983267 на хромосоме 8. Cancer Res. 2008; 68: 9982–9986. [PubMed] [Google Scholar] 46.Джиа Л., Ландан Дж., Померанц М., Яшек Р., Герман П., Райх Д. и др. Функциональные энхансеры в бедном генами локусе, сцепленном с раком 8q24. PLoS Genet. 2009; 5: e1000597. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 47. Сотело Дж., Эспозито Д., Духагон М.А., Банфилд К., Мехалко Дж., Ляо Х. и др. Усилители дальнего действия на 8q24 регулируют c-Myc. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2010; 107: 3001–3005. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

Локус тяжелой цепи иммуноглобулина: генетическая изменчивость, недостающие данные и последствия для болезней человека

1

Мерфи К.М., Трэверс П., Уолпорт М. Janeway’s Immunobiology 7-е изд. Garland Science London, 2007.

Google ученый

2

Lefranc M-P, Lefranc G. The Immunoglobulin FactsBook . Academic Press, Лондон, 2001.

Google ученый

3

Lefranc M-P, Lefranc G. Книга фактов о Т-клеточных рецепторах . Academic Press, Лондон, 2001.

Google ученый

4

Тонегава С.Соматическая генерация разнообразия антител. Nature 1983; 302 : 575–581.

CAS Статья Google ученый

5

Лю Л., Лукас А.Х. IGH V3-23 * 01 и его аллель V3-23 * 03 различаются по своей способности образовывать сайт связывания канонических антител человека, специфичный для капсульного полисахарида Haemophilus influenzae типа B. Immunogenetics 2003; 55 : 336–338.

CAS PubMed Google ученый

6

Бойд С.Д., Гаэта Б.А., Джексон К.Дж., Файр АЗ, Маршалл Э.Л., Меркер Дж.Д. и др. .Индивидуальные вариации в репертуаре генов Ig зародышевой линии, выведенные из реаранжировки генов вариабельной области. J Immunol 2010; 184 : 6986–6992.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

7

Glanville J, Kuo TC, von Budingen HC, Guey L, Berka J, Sundar PD et al . Частоты генных сегментов наивных антител наследуются и не изменяются хронической аблацией лимфоцитов. Proc Natl Acad Sci USA 2011; 108 : 20066–20071.

CAS PubMed Google ученый

8

Консорциум проекта «1000 геномов» Карта вариаций генома человека на основе секвенирования в масштабе популяции. Nature 2010; 467 : 1061–1073.

Google ученый

9

Мацуда Ф., Исии К., Бурвагнет П., Кума К., Хаяшида Х., Мията Т и др. . Полная нуклеотидная последовательность локуса вариабельной области тяжелой цепи иммуноглобулина человека. J Exp Med 1998; 188 : 2151–2162.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

10

IMGT. Международная информационная система ImMunoGeneTics: http://www.imgt.org.

11

Палларес Н, Лефевр С., Конте В, Мацуда Ф, Лефранк М.П. Вариабельные гены тяжелого иммуноглобулина человека. Exp Clin Immunogenet 1999; 16 : 36–60.

PubMed Google ученый

12

Руис М., Палларес Н., Конте В., Барби В., Лефранк М.П.Сегменты большого разнообразия иммуноглобулинов человека (IGHD) и сращивания (IGHJ). Exp Clin Immunogenet 1999; 16 : 173–184.

CAS PubMed Google ученый

13

Лефранк М.П. Номенклатура генов тяжелого иммуноглобулина человека (IGH). Exp Clin Immunogenet 2001; 18 : 100–116.

CAS PubMed Google ученый

14

Лефранк МП.Номенклатура генов тяжелого иммуноглобулина человека (IGH). В: Текущие протоколы в иммунологии . Джон Вили и сыновья Хобокен, 2001.

Google ученый

15

Джудичелли В., Чауме Д., Лефранк М.П. IMGT / GENE-DB: обширная база данных по генам иммуноглобулинов человека и мыши и Т-клеточных рецепторов. Nucleic Acids Res 2005; 33 : D256 – D261.

CAS PubMed Google ученый

16

База данных полиморфизма иммуноглобулинов: cgi.cse.unsw.edu.au/∼ihmmune/IgPdb/.

17

Ван И, Джексон К.Дж., Гаэта Б., Помат В., Сиба П., Сьюэлл В.А. и др. . Геномный скрининг с помощью пиросеквенирования 454 идентифицирует новый ген IGHV человека и шестнадцать других новых аллельных вариантов IGHV. Immunogenetics 2011; 63 : 259–265.

PubMed Google ученый

18

Romo-Gonzalez T, Morales-Montor J, Rodriguez-Dorantes M, Vargas-Madrazo E.Новые замещающие полиморфизмы генов VH человеческого иммуноглобулина у мексиканцев. Hum Immunol 2005; 66 : 732–740.

CAS PubMed Google ученый

19

Lefranc MP, Lefranc G, Rabbitts TH. Унаследованная делеция генов константной области тяжелой цепи иммуноглобулина у нормальных людей. Nature 1982; 300 : 760–762.

CAS PubMed Google ученый

20

Lefranc G, Chaabani H, Van Loghem E, Lefranc MP, De Lange G, Helal AN.Одновременное отсутствие подклассов человеческого IgG1, IgG2, IgG4 и IgA1: иммунологические и иммуногенетические соображения. Eur J Immunol 1983; 13 : 240–244.

CAS PubMed Google ученый

21

Lefranc MP, Lefranc G, de Lange G, Out TA, van den Broek PJ, van Nieuwkoop J и др. . Нестабильность локуса константной области тяжелой цепи иммуноглобулина человека, на которую указывают различные наследуемые хромосомные делеции. Mol Biol Med 1983; 1 : 207–217.

CAS PubMed Google ученый

22

Keyeux G, Lefranc G, Lefranc MP. Мультигенная делеция в локусе константной области человеческого IGH включает высокогомологичные горячие точки рекомбинации. Genomics 1989; 5 : 431–441.

CAS PubMed Google ученый

23

Лефранк М.П., ​​Хаммарстрём Л., Смит К.И., Лефранк Г.Делеции генов в локусе константной области тяжелой цепи иммуноглобулина человека: молекулярный и иммунологический анализ. Immunodefic Rev 1991; 2 : 265–281.

CAS PubMed Google ученый

24

Wiebe V, Helal A, Lefranc MP, Lefranc G. Молекулярный анализ мультигенной делеции CH иммуноглобулина T17 (del A1-GP-G2-G4-E). Hum Genet 1994; 93 : 520–528.

CAS PubMed Google ученый

25

Hammarström L, Ghanem N, Smith CI, Lefranc G, Lefranc MP.ПДРФ генов иммуноглобулинов человека. Exp Clin Immunogenet 1990; 7 : 7–19.

PubMed Google ученый

26

Чен П.П., Ян П.М. Дублирован сегмент локуса гена Vh человека. Scand J Immunol 1990; 31 : 593–599.

CAS PubMed Google ученый

27

Сассо Э. Х., Виллемс ван Дейк К., Булл А. П., Милнер Э.Ген иммуноглобулина Vh2, экспрессируемый плодами, принадлежит к сложному набору аллелей. J Clin Invest 1993; 91 : 2358–2367.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

28

Шин Е.К., Мацуда Ф., Одзаки С., Кумагаи С., Олеруп О., Стрем Х. и др. . Полиморфизм сегмента вариабельной области иммуноглобулина человека V1-4.1. Immunogenetics 1993; 38 : 304–306.

CAS PubMed Google ученый

29

Sasso EH, Buckner JH, Suzuki LA.Этнические различия в полиморфизме гена VH. Ann NY Acad Sci 1995; 764 : 72–73.

CAS PubMed Google ученый

30

Milner EC, Hufnagle WO, Glas AM, Suzuki I, Alexander C. Полиморфизм и использование генов VH человека. Ann NY Acad Sci 1995; 764 : 50–61.

CAS PubMed Google ученый

31

Уолтер М.А., Сурти Ю., Хофкер М. Х., Кокс Д. В..Физическая организация генного комплекса тяжелой цепи иммуноглобулина человека. EMBO J 1990; 9 : 3303–3313.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

32

Шин Е.К., Мацуда Ф., Нагаока Х., Фукита Ю., Имаи Т., Йокояма К. и др. . Физическая карта 3′-области локуса тяжелой цепи иммуноглобулина человека: кластеризация вариабельных сегментов, связанных с аутоантителами, в одном гаплотипе. EMBO J 1991; 10 : 3641–3645.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

33

Уолтер Дж., Томлинсон И. М., Повар ГП, Уинтер Джи, Кролик Т. Х., Уважаемый PH. HAPPY-картирование YAC выявляет альтернативные гаплотипы в локусе VH иммуноглобулина человека. Nucleic Acids Res 1993; 21 : 4524–4529.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

34

Кук Г.П., Томлинсон И.М., Уолтер Дж., Ритман Х., Картер Н.П., Булувела Л. и др. .Карта локуса VH иммуноглобулина человека завершена анализом теломерной области хромосомы 14q. Nat Genet 1994; 7 : 162–168.

CAS PubMed Google ученый

35

Cook GP, Tomlinson IM. Репертуар VH иммуноглобулинов человека. Immunol Today 1995; 16 : 237–242.

CAS PubMed Google ученый

36

Cui X, Li H.Определение генной организации в отдельных гаплотипах путем анализа отдельных фрагментов ДНК из отдельных сперматозоидов. Proc Natl Acad Sci USA 1998; 95 : 10791–10796.

CAS PubMed Google ученый

37

Праманик С., Ли Х. Прямое обнаружение полиморфизма вставок / делеций в аутосомной области путем анализа маркеров высокой плотности в отдельных сперматозоидах. Am J Hum Genet 2002; 71 : 1342–1352.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

38

Чимге NO, Pramanik S, Hu G, Lin Y, Gao R, Shen L et al . Определение генной организации в области человеческого IGHV на отдельных хромосомах. Genes Immun 2005; 6 : 186–193.

CAS PubMed Google ученый

39

Pramanik S, Cui X, Wang HY, Chimge NO, Hu G, Shen L и др. .Сегментная дупликация как одна из движущих сил, лежащих в основе разнообразия вариабельной области гена тяжелой цепи иммуноглобулина человека. BMC Genomics 2011; 12 : 78.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

40

Кидд MJ, Chen Z, Wang Y, Jackson KJ, Zhang LN, Boyd SD et al . Выявление поэтапных гаплотипов для локусов гена V-области H-цепи иммуноглобулина путем анализа перестроек генов VDJ. J Immunol 2012; 188 : 1333–1340.

CAS PubMed Google ученый

41

Чо С.С., Ван Х, Чжао И, Карсон Д.А., Чен П.П. Генотипирование с помощью ПЦР-ИФА сложной полиморфной области, которая содержит от одной до четырех копий шести высокогомологичных генов Vh4 человека. Proc Assoc Am Physitors 1997; 109 : 558–564.

CAS PubMed Google ученый

42

Romo-Gonzalez T, Vargas-Madrazo E.Структурный анализ паттернов замен в аллелях генов VH иммуноглобулина человека. Mol Immunol 2005; 42 : 1085–1097.

CAS PubMed Google ученый

43

Лефранк МП. Уникальная нумерация IMGT для вариабельного (V), константного (C) и бороздчатого (G) доменов IG, TR, MH, IgSF и MhSF. Cold Spring Harb Protoc 2011; 2011 : 633–642.

PubMed Google ученый

44

Лефранк МП.IMGT Collier de Perles для вариабельного (V), константного (C) и бороздчатого (G) доменов IG, TR, MH, IgSF и MhSF. Cold Spring Harb Protoc 2011; 2011 : 643–651.

PubMed Google ученый

45

Эренманн Ф., Лефранк М.П. IMGT / 3D structure-DB: запрос в базе данных IMGT трехмерных структур в иммунологии и иммуноинформатике (IG или антитела, TR, MH, RPI и FPIA). Cold Spring Harb Protoc 2011; 2011 : 750–761.

PubMed Google ученый

46

Scott MG, Crimmins DL, McCourt DW, Zocher I, Thiebe R, Zachau HG et al . Клональная характеристика репертуара человеческих антител IgG к полисахариду Haemophilus influenzae типа b. III. Один ген VKII и один из нескольких генов JK соединены инвариантным аргинином, образуя наиболее распространенную V-область L-цепи. J Immunol 1989; 143 : 4110–4116.

CAS PubMed Google ученый

47

Фини А.Дж., Аткинсон М.Дж., Коуэн М.Дж., Эскуро Дж., Луго Дж. Дефектный аллель Vkappa A2 у навахо, который может играть роль в повышенной восприимчивости к болезни Haemophilus influenzae типа b. J Clin Invest 1996; 97 : 2277–2282.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

48

Надел Б., Танг А., Луго Дж., Лав В., Эскуро Дж., Фини А.Дж.Снижение частоты реаранжировки из-за синергетического эффекта нуклеотидных изменений в гептамере и нонамере сигнальной последовательности рекомбинации гена V каппа A2b, что связано с повышенной восприимчивостью навахо к болезни Haemophilus influenzae типа b. J Immunol 1998; 161 : 6068–6073.

CAS PubMed Google ученый

49

Сассо Э.Х., Джонсон Т., Киппс Т.Дж.Экспрессия гена 51p1 иммуноглобулина VH пропорциональна количеству копий его гена зародышевой линии. J Clin Invest 1996; 97 : 2074–2080.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

50

Sasso EH, Ghillani P, Musset L, Piette JC, Cacoub P. Влияние количества копий гена 51p1 (локус V1-69) на продукцию криоглобулинов, связанных с гепатитом С. Clin Exp Immunol 2001; 123 : 88–93.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

51

Watson CT, Ramagopalan SV, Morrison KM, Ebers GC, Breden F. Полиморфизм делеции IGHV4-39 не связан с риском или исходом рассеянного склероза. J Neuroimmunol 2010; 225 : 164–166.

CAS PubMed Google ученый

52

van Zelm MC, Geertsema C, Nieuwenhuis N, de Ridder D, Conley ME, Schiff CC et al .Грубые делеции с участием IGHM, BTK или Artemis: модель геномных повреждений, опосредованных мобильными элементами. Am J Hum Genet 2008; 82 : 320–332.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

53

Прабакаран П., Чен В., Сингараян М.Г., Стюарт С.К., Стрикер Э., Фэн И и др. . Репертуары экспрессированных антител в клетках пуповинной крови человека: секвенирование 454 и анализ использования генов зародышевой линии, разнообразия соединений и соматических мутаций IMGT / HighV-QUEST. Immunogenetics 2011; 5 : 337–350.

Google ученый

54

Foreman AL, Van de Water J, Gougeon ML, Gershwin ME. В-клетки при аутоиммунных заболеваниях: выводы из анализов использования вариабельного гена иммуноглобулина (Ig V). Autoimmun Rev 2007; 6 : 387–401.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

55

Scheid JF, Mouquet H, Feldhahn N, Seaman MS, Velinzon K, Pietzsch J et al .Широкое разнообразие нейтрализующих антител, выделенных из В-клеток памяти у ВИЧ-инфицированных. Nature 2009; 458 : 636–640.

CAS PubMed Google ученый

56

Горный М.К., Ван XH, Уильямс С., Вольский Б., Ревес К., Витовер Б. и др. . Предпочтительное использование сегмента гена VH5-51 иммунным ответом человека для кодирования антител против домена V3 ВИЧ-1. Mol Immunol 2009; 46 : 917–926.

CAS PubMed Google ученый

57

Бреден Ф, Лепик С, Лонго Н.С., Монтеро М, Липски П.Е., Скотт Дж. Сравнение репертуаров антител, продуцируемых инфекцией ВИЧ-1, другими хроническими и острыми инфекциями и системным аутоиммунным заболеванием. PLoS One 2011; 6 : e16857.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

58

Huang CC, Venturi M, Majeed S, Moore MJ, Phogat S, Zhang MY и др. .Структурная основа сульфатирования тирозина и использования гена VH в антителах, которые распознают сайт связывания корецептора ВИЧ типа 1 на gp120. Proc Natl Acad Sci USA 2004; 101 : 2706–2711.

CAS PubMed Google ученый

59

Kashyap AK, Steel J, Oner AF, Dillon MA, Swale RE, Wall KM и др. . Библиотеки комбинаторных антител от выживших после вспышки птичьего гриппа H5N1 в Турции раскрывают стратегии нейтрализации вируса. Proc Natl Acad Sci USA 2008; 105 : 5986–5991.

CAS PubMed Google ученый

60

Тросби М., Ван ден Бринк Э., Йонгенилен М., Пун Л.Л., Алард П., Корнелиссен Л. и др. . Гетероподтипные нейтрализующие моноклональные антитела, перекрестно защищающие от H5N1 и h2N1, полученные из B-клеток памяти IgM + человека. PLoS One 2008; 3 : e3942.

PubMed PubMed Central Google ученый

61

Суи Дж., Хван В.С., Перес С., Вей Дж., Эйрд Д., Чен Л. М. и др. .Структурные и функциональные основы нейтрализации широкого спектра действия вирусов птичьего и человеческого гриппа А. Nat Struct Mol Biol 2009; 16 : 265–273.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

62

Лернер РА. Редкие антитела из комбинаторных библиотек предполагают S.O.S. компонент иммунологического репертуара человека. Мол Биосист 2011; 7 : 1004–1012.

CAS PubMed Google ученый

63

Sui J, Sheehan J, Hwang WC, Bankston LA, Burchett SK, Huang CY et al .Широкое распространение гетероподтипных широко нейтрализующих человеческих антител против гриппа А. Clin Infect Dis 2011; 52 : 1003–1009.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

64

Wrammert J, Koutsonanos D, Li GM, Edupuganti S, Sui J, Morrissey M et al . Антитела с широкой перекрестной реакцией доминируют в ответе В-клеток человека против инфекции, вызванной пандемическим вирусом гриппа h2N1 2009 года. J Exp Med 2011; 208 : 181–193.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

65

Cho ML, Chen PP, Seo YI, Hwang SY, Kim WU, Min DJ et al . Ассоциация гомозиготной делеции генов Humhv3005 и Vh4-30.3 с поражением почек при системной красной волчанке. Lupus 2003; 12 : 400–405.

CAS PubMed Google ученый

66

Олее Т., Янг П.М., Симинович К.А., Олсен Нью-Джерси, Хиллсон Дж., Ву Дж. и др. .Молекулярная основа полиморфизма длины рестрикционного фрагмента, связанного с аутоантителами, который придает предрасположенность к аутоиммунным заболеваниям. J Clin Invest 1991; 88 : 193–203.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

67

Mo L, Leu SJ, Berry C, Liu F, Olee T, Yang YY и др. . Частота гомозиготной делеции гена Vh, регулируемого развитием (Humhv3005), увеличивается у пациентов с хронической идиопатической тромбоцитопенической пурпурой. Аутоиммунитет 1996; 24 : 257–263.

CAS PubMed Google ученый

68

Грегерсен П.К., Олссон Л.М. Последние достижения в генетике аутоиммунных заболеваний. Annu Rev Immunol 2009; 27 : 363–391.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

69

Венцовски Дж., Зд’арски Э., Мойес С.П., Хаджир А., Ружичкова С., Цимбурек З. и др. .Полиморфизм гена VH иммуноглобулина V1-69 влияет на предрасположенность к ревматоидному артриту у субъектов, лишенных общего эпитопа HLA-DRB1. Ревматология (Оксфорд) 2002; 41 : 401–410.

CAS Google ученый

70

Цай Ф.Дж., Ли Ю.С., Чанг Дж.С., Хуанг Л.М., Хуанг Ф.Й., Чиу NC и др. . Идентификация новых локусов восприимчивости к болезни Кавасаки в китайской популяции хань с помощью полногеномного исследования ассоциации. PLoS One 2011; 6 : e16853.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

71

Уолтер М.А., Гибсон В.Т., Эберс Г.К., Кокс Д.В. Восприимчивость к рассеянному склерозу связана с проксимальной вариабельной областью тяжелой цепи иммуноглобулина. J Clin Invest 1991; 87 : 1266–1273.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

72

Хашимото Л.Л., Уолтер М.А., Кокс Д.В., Эберс Г.К.Полиморфизм вариабельной области тяжелой цепи иммуноглобулина и восприимчивость к рассеянному склерозу. J Neuroimmunol 1993; 44 : 77–83.

CAS PubMed Google ученый

73

Соцер С., Джонс Х. Б., Фикс Р., Грей Дж., Смолдон Н., Чатавей Дж. и др. . Скрининг генома при рассеянном склерозе выявляет локусы восприимчивости на хромосомах 6p21 и 17q22. Nat Genet 1996; 13 : 464–468.

CAS PubMed Google ученый

74

Feakes R, Chataway J, Sawcer S, Jones HB, Clayton D, Goodfellow PN et al . Восприимчивость к рассеянному склерозу и кластер генов тяжелой цепи иммуноглобулина. Ann Neurol 1998; 44 : 984.

CAS PubMed Google ученый

75

Фикс Р., Соцер С., Смилли Б., Чатавей Дж., Бродли С., Компстон ​​А.Нет доказательств участия интерлейкина 2 или кластера генов тяжелой цепи иммуноглобулина в определении генетической предрасположенности к рассеянному склерозу. J Neurol Neurosurg Psychiatry 2000; 68 : 679.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

76

Уолтер М.А., Кокс DW. Неоднородное нарушение равновесия по сцеплению в области 1500 т.п.н. комплекса тяжелых цепей иммуноглобулина человека. Am J Hum Genet 1991; 49 : 917–931.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

77

Terwilliger JD, Hiekkalinna T. Полное опровержение «фундаментальной теоремы HapMap». евро J Hum Genet 2006; 14 : 426–437.

CAS PubMed Google ученый

78

Барретт Дж. К., Фрай Б., Маллер Дж., Дейли М. Дж. Haploview: анализ и визуализация карт LD и гаплотипов. Bioinformatics 2005; 21 : 263–265.

CAS Google ученый

79

де Баккер П.И., Еленский Р., Пеер И., Габриэль С.Б., Дали М.Дж., Альтшулер Д. Эффективность и мощность в исследованиях генетических ассоциаций. Nat Genet 2006; 37 : 1217–1223.

Google ученый

80

Манолио Т.А., Коллинз Ф.С., Кокс, штат Нью-Джерси, Голдштейн Д.Б., Хиндорф Л.А., Хантер DJ и др. .Обнаружение недостающей наследственности сложных заболеваний. Nature 2009; 461 : 747–753.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

81

Эйхлер Е.Е., Флинт Дж., Гибсон Дж., Конг А., Леал С.М., Мур Дж. Х. и др. . Отсутствие наследственности и стратегий поиска основных причин сложного заболевания. Nat Rev Genet 2010; 11 : 446–450.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

82

Конрад Д.Ф., Пинто Д., Редон Р., Феук Л., Гоккумен О., Чжан И. и др. .Происхождение и функциональное влияние вариаций числа копий в геноме человека. Nature 2010; 464 : 704–712.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

83

Craddock N, Hurles ME, Cardin N, Pearson RD, Plagnol V, Robson S et al . Полногеномное исследование ассоциации CNV в 16 000 случаев восьми распространенных заболеваний и 3 000 общих контрольных заболеваний. Nature 2010; 464 : 713–720.

CAS PubMed Google ученый

84

Като М., Кавагути Т., Исикава С., Умеда Т., Накамичи Р., Шаперо М.Н. и др. . Популяционно-генетическая природа вариаций числа копий в геноме человека. Hum Mol Genet 2010; 19 : 761–773.

CAS PubMed Google ученый

85

Кэмпбелл С.Д., Сампас Н., Цаленко А., Судмант PH, Кидд Дж. М., Малиг М. и др. .Популяционно-генетические свойства дифференцированных полиморфизмов копий человека. Am J Hum Genet 2011; 88 : 317–332.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

86

Леви С., Саттон Дж., Нг ПК, Феук Л., Халперн А.Л., Валенц Б.П. и др. . Последовательность диплоидного генома отдельного человека. PLoS Biol 2007; 5 : e254.

PubMed PubMed Central Google ученый

87

Axelrod N, Lin Y, Ng PC, Stockwell TB, Crabtree J, Huang J et al .Браузер HuRef: веб-ресурс по геномике человека. Nucleic Acids Res 2009; 37 (Выпуск базы данных) D1018 – D1024.

CAS PubMed Google ученый

88

Alkan C, Sajjadian S, Eichler EE. Ограничения сборки последовательности генома следующего поколения. Nat. Методы 2011; 8 : 61–65.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

89

Tuzun E, Sharp AJ, Bailey JA, Kaul R, Morrison VA, Pertz LM et al .Мелкомасштабные структурные вариации генома человека. Nat Genet 2005; 37 : 727–732.

CAS PubMed Google ученый

90

Кидд Дж. М., Купер Г. М., Донахью В. Ф., Хайден Х. С., Сампас Н., Грейвс Т. и др. . Картирование и секвенирование структурных вариаций восьми геномов человека. Nature 2008; 453 : 56–64.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

91

Кидд Дж. М., Сампас Н., Антоначчи Ф., Грейвс Т., Фултон Р., Хайден Х. С. и др. .Характеристика отсутствующих последовательностей генома человека и полиморфных вставок числа копий. Nat Methods 2010; 7 : 365–371.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

92

Миллс Р.Э., Уолтер К., Стюарт С., Хандакер Р.Э., Чен К., Алкан С. и др. . Картирование вариации числа копий путем секвенирования генома в масштабе популяции. Nature 2011; 470 : 59–65.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

93

Хуанг Д.Ф., Симинович К.А., Лю XY, Олее Т., Олсен Нью-Джерси, Берри С. и др. .Популяционные и семейные исследования трех полиморфных генов, связанных с заболеванием, при системной красной волчанке. J Clin Invest 1995; 95 : 1766–1772.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

94

Veijola R, Knip M, Puukka R, Reijonen H, Cox DW, Ilonen J. Вариабельная область тяжелой цепи иммуноглобулина при инсулинозависимом сахарном диабете: анализ пары затронутых сиб-пар и исследования ассоциации. Am J Hum Genet 1996; 59 : 462–470.

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

95

Филд Л.Л., Ларсен З., Посио Ф., Неруп Дж., Тобиас Р., Бонневи-Нильсен В. Доказательства наличия локуса (IDDM16) в области тяжелой цепи иммуноглобулина на хромосоме 14q32.3, вызывающего предрасположенность к диабету 1 типа. Genes Immun 2002; 3 : 338–344.

CAS PubMed Google ученый

Локус и определение круга и сферы — концепция

Локус — это набор точек, удовлетворяющих заданному условию.Определение окружности точек на заданном расстоянии от заданной точки в 2-мерной плоскости. Заданное расстояние — это радиус, а данная точка — центр круга. В трехмерном пространстве (пространстве) мы бы определили сферу как набор точек в пространстве на заданном расстоянии от заданной точки.

Термин в геометрии, который немного сбивает с толку, — это Locus, и мы не говорим здесь об одной из бед.мы говорим о наборе точек, которые удовлетворяют заданному условию, поэтому, чтобы изучить, что это означает, давайте рассмотрим 2 примера, первый из которых говорит, что нужно провести все точки на расстоянии 5 сантиметров от точки p на плоскости. Итак, точка p — это плоскость доски. Помните, что самолеты двухмерны, и они бесконечно простираются во всех направлениях. Так что, если я начну думать о 5 сантиметрах, вы, вероятно, знаете о них прямо здесь, и точка в 5 сантиметрах от точки p может оказаться прямо там. У меня также может быть точка с другой стороны от точки p, и я могу продолжать находить точки, которые находятся примерно в 5 сантиметрах от точки p, пока я не посинеешь.
И, как вы в конце концов увидите, если бы я делал это достаточно долго, у меня был бы круг. Таким образом, локус — это все эти точки, которые удовлетворяют определенному условию, и в этом случае эта точка указана в 5 сантиметрах от точки p на этой плоскости. Это приводит нас к нашему определению круга, который представляет собой геометрическое место точек на заданном расстоянии от заданной точки на плоскости. Так что это довольно длинный способ сказать, что если я даю вам точку, круг по определению — это все те точки, которые находятся на определенном расстоянии от той точки, которую я вам дал.
Вернемся ко второму примеру, во втором примере говорится, что нарисуйте все точки на расстоянии 5 сантиметров от точки o в пространстве. Итак, у нас есть точка «o», и, очевидно, я не смогу нарисовать пространство, которое выходит на вас и входит в доску, но я могу предположить. Что ж, это будет выглядеть так: у нас будут все эти точки, которые будут в плоскости доски, а затем у нас будут точки, которые будут выходить за пределы доски, так что я думаю что я могу сделать, так это нарисовать здесь своего рода кривую, которая покажет все точки, которые поднимаются, и я собираюсь нарисовать пунктирную линию для всех точек, которые входят в доску, обратно в доску, которые имеют 5 в сантиметрах.Итак, мы нарисовали сферу, так что это определение сферы, которая связана с кругом плюс сферы, говорящие о трех измерениях. Итак, это геометрическое место точек, которые находятся на заданном расстоянии от точки в пространстве. Итак, мы говорим о трех измерениях, которые представляют собой пространство, в котором мы живем. Таким образом, ключевая концепция заключается в том, что локус — это все точки, которые соответствуют заданному условию.

Определение локуса контроля

Локус контроля — это психологическое понятие, которое относится к тому, насколько сильно люди верят, что они контролируют ситуации и события, которые влияют на их жизнь. В образовании локус контроля обычно относится к тому, как учащиеся воспринимают причины своих академических успехов или неудач в школе.

Учащиеся с «внутренним локусом контроля» обычно считают, что их успех или неудача являются результатом усилий и упорного труда, которые они вкладывают в свое образование. Учащиеся с «внешним локусом контроля» обычно считают, что их успехи или неудачи являются результатом внешних факторов, находящихся вне их контроля, таких как удача, судьба, обстоятельства, несправедливость, предвзятость или несправедливые, предвзятые или неквалифицированные учителя. Например, учащиеся с внутренним локусом контроля могут винить плохие оценки в своей неуспеваемости, тогда как учащиеся с внешним локусом контроля могут обвинять несправедливого учителя или тест в своей плохой успеваемости.

Считается, что наличие у ученика внутреннего или внешнего локуса контроля оказывает сильное влияние на академическую мотивацию, настойчивость и успеваемость в школе. В образовании считается, что «внутренние» с большей вероятностью будут усердно работать, чтобы учиться, прогрессировать и добиться успеха, в то время как «внешние» с большей вероятностью верят, что усердный труд «бессмысленен», потому что кто-то или что-то еще обращается с ними несправедливо или придерживает их обратно.Учащиеся с внешним локусом контроля также могут полагать, что их достижения не будут признаны или их усилия не приведут к успеху.

В специальном образовании концепция локуса контроля особенно важна. Многие преподаватели считают, что учащиеся с нарушением обучаемости с большей вероятностью разовьют внешний локус контроля, по крайней мере, частично из-за негативного опыта, который они могли получить в школе. Если из-за их инвалидности обучение стало исключительно трудным или сложным, и, следовательно, они испытали больше неудач, чем успехов в школе, обвинение других людей и внешних факторов может развиться в психологический механизм выживания (т.д., когда кто-то или что-то другое всегда является причиной, ученикам не нужно брать на себя больше ответственности за свои успехи в школе).

Соответствующие обсуждения см. В разделе «установка на рост и угроза стереотипов».

Локус контроля связан с множеством психологических концепций, теорий и открытий, включая усвоенную беспомощность, когда человек научился действовать так, как будто он беспомощен, даже если он действительно имеет контроль над своей ситуацией или способность действовать. изменить обстоятельства или результат.Некоторые психологи считают, что «внешние» с большей вероятностью разовьют выученную беспомощность, чем «внутренние».

Реформа

В последние десятилетия понятие локуса контроля стало более широко признанным и обсуждаемым понятием в образовании. Есть два основных подхода, которые школы используют при работе с учащимися с ограниченными возможностями обучения, имеющими внешний локус контроля:

• Изменение контекстов обучения: Считается, что более структурированные, упорядоченные и поддерживающие классы и учебная среда приносят пользу учащимся с внешним локусом контроля, в то время как учащиеся с внутренним локусом контроля часто преуспевают в более неструктурированной учебной среде.
• Усиление внутреннего локуса контроля: Педагоги и специалисты могут также использовать различные стратегии, чтобы побудить учащихся поверить в то, что они имеют больший контроль над своим образованием и академической успеваемостью, включая методы, известные как «обучение атрибуции». По сути, студентов учат усваивать позитивные сообщения, которые интуитивно понятны студентам с внутренним локусом контроля. Например, обучение может побуждать студентов говорить себе — сначала вслух, затем шепотом, а затем молча про себя, — что они могут выполнить задание, которое им было поручено, и что их тяжелый труд и усилия будут вознаграждены успех.

Было разработано несколько анкет, чтобы помочь определить, склонны ли студенты к внутреннему или внешнему локусу контроля. Джулиан Б. Роттер, психолог, который первоначально разработал концепцию локуса контроля, создал широко используемую оценку на основе вопросов и соответствующую шкалу, предназначенную для определения того, где учащиеся находятся во внутреннем и внешнем спектре. Анкета предлагает несколько вариантов выбора между двумя утверждениями. Например, респондент мог бы выбирать между «Я часто обнаруживал, что то, что должно произойти, произойдет» или «Вера в судьбу никогда не была для меня такой же хорошей, как принятие решения о выборе определенного курса действий.«Оценка Роттера — один из множества диагностических инструментов и шкал, которые могут использоваться психологами и педагогами.

Происхождение и поведение мутабельных локусов у кукурузы

В ходе эксперимента, направленного на выявление генного состава короткого плеча хромосомы 9, явление, которое редко встречается (или распознается) у кукурузы, начало проявляться с удивительно высокой частотой. в культурах. К этому явлению были применены термины «мутабельные гены», «нестабильные гены», «пестрота», «мозаицизм», «мутабельные локусы» или «эффект положения».Его наличие у самых разных организмов было признано. Наиболее обширные исследования этого явления проведены на Drosophila melanogaster . ¹ В этом организме хорошо определены условия, связанные с происхождением генной нестабильности. Установлена ​​роль гетерохроматических материалов хромосом в индукции и контроле типа пестроты, времени и частоты ее появления. В целом не было признано, что нестабильность генной экспрессии у других организмов может быть по существу такой же, как у дрозофилы.

Как указано выше, большое количество мутабельных локусов недавно возникло в культурах кукурузы и продолжает возникать заново. Локусы влияют на пестроту многих различных видов растений, каждый из которых связан с определенным признаком, а иногда и с несколькими признаками. Некоторые из этих локусов — c, yg ₂ , wx, a ₂ , y, pyd , которые являются хорошо изученными единицами кукурузы. ² Другие связаны с ранее неизвестными генетическими единицами.Такие же типы генной нестабильности, которые проявляются в культурах кукурузы, описаны у многих других организмов. Поведение этих новых мутабельных локусов у кукурузы нельзя считать специфическим для этого организма. Автор считает, что механизм, лежащий в основе феномена пестроты, в основном одинаков у всех организмов. Причины этого вывода станут очевидны в ходе обсуждения.

Первоначальное появление всплеска вновь возникающих мутабельных локусов произошло в потомстве, появившемся в результате самоопыления около 450 растений, каждое из которых в своем раннем развитии претерпело серию событий, когда короткое плечо хромосомы 9 подверглось сильному воздействию. структурные модификации.Эти события имели место во время «хромосомного типа» цикла разрыв-слияние-мост. ³ Модификации, производимые этим механизмом, включают: одну или несколько дупликаций сегментов короткого плеча, недостатки одного или нескольких сегментов различной длины, структурные модификации вещества гетерохроматической ручки, дупликации выступов со структурными модификациями или без них, и различные комбинации этих нескольких типов модификаций. Хромосомный набор более 150 из этих растений был исследован на пахитене, чтобы определить природу произошедших структурных модификаций.В дополнение к модификациям короткого плеча хромосомы 9, перечисленным выше, у некоторых растений были другие модификации, многие из которых особенно важны, потому что они включают в себя вещества в хромосоме, которые, как считается, ответственны за происхождение и поведение изменчивых loci — гетерохроматиновые выступы и центромеры. Всего было проанализировано 48 таких структурных модификаций, в частности, у вышеупомянутых растений, но также и у некоторых других растений, которые получили хромосому 9 с недавно разорванным концом.Четырнадцать связаны с модификациями хромосомы 9, отличными от перечисленных выше (телоцентрические хромосомы, изохромосомы, дополнительные хромосомы 9 с определенными модификациями и т. Д.). Четыре возникли в результате слияния центромеры хромосомы 9 с центромерой другой хромосомы. Четыре являются результатом слияния вещества выступа короткого плеча хромосомы 9 с центромерой хромосомы 9. Двадцать четыре являются результатом слияния вещества выступа короткого плеча хромосомы 9 с другими участками хромосомного набора: восемнадцать были с другие выступы или с областями, очень близкими к этим выступам, четыре были недостаточно проанализированы в отношении положения слияния, а два не затрагивали известные области выступов.В двух случаях инверсии присутствовали в других хромосомах. Вовлеченными регионами были выступ и центромера в одной из этих хромосом, а также организатор ядрышка и центромера в другой хромосоме. Не может быть никаких сомнений в том, что эти «спонтанные транслокации» не случайны в отношении расположения разрывов и слияний. В основном задействованы гетерохроматиновые выступы и центромеры.

В культурах, полученных в результате самоопыления растений, которые в раннем развитии подверглись хромосомному циклу разрыва-слияния-моста, было распознано около 40 различных мутабельных локусов.Большинство таких мутабельных локусов не могло присутствовать у родителей этих растений, поскольку запасы, из которых они произошли, изучались в течение нескольких лет, и не было обнаружено доказательств присутствия такого большого количества нестабильных локусов. Таким образом, был сделан вывод, что либо какая-то часть механизма, связанная с циклом разрыва-слияния-моста, либо некоторые структурные модификации, возникающие в результате этого, несут ответственность за условия, которые привели к этому взрыву. То, что некоторые из мутабельных локусов были расположены в хромосоме 9 или были связаны с ней, было установлено в первых тестах.Другие мутабельные локусы, с другой стороны, не показали какой-либо очевидной ассоциации с хромосомой 9.

Мутабельные локусы делятся на два основных класса: (1) те, которые требуют отдельного фактора активатора для проявления нестабильности, и (2) те, которые автономны по отношению к фактору, контролирующему начало изменчивости. Их также можно подразделить по совершенно разному признаку. Это связано с типами выражения возникающих мутаций. Присутствуют следующие типы: ( a ) Изменения от мутанта к экспрессии дикого типа или близкие к ней.После такой мутации локус может навсегда стабилизироваться. Он может больше не свидетельствовать о феномене нестабильности. ( b ) Вторая группа, аналогичная ( a ), за исключением того, что мутация дикого типа не приводит к стабильности локуса. Локус-продуцент дикого типа, в свою очередь, может мутировать, давая рецессивную экспрессию. ( c ) Третий тип, при котором мутации вызывают серию аллелей затронутых локусов. Эти аллели отличаются разной степенью количественного выражения нормального фенотипа.Большинство из них относительно стабильны; лишь изредка снова возникает нестабильность. ( d ) Четвертый тип, аналогичный ( c ). Однако большинство аллелей нестабильны, поскольку они, в свою очередь, могут мутировать в направлении более или менее выраженного количественного выражения фенотипа. Мутабельные локусы, демонстрирующие эти различные типы экспрессии мутации, обнаруживаются в обоих основных классах, то есть в классе, требующем активатора, и в автономном классе.

Накопленные наблюдения и данные исследования ряда этих мутабельных локусов настолько обширны, что никакой краткий отчет не даст достаточной информации, чтобы подготовить читателя к независимому суждению о природе явления.Понятно, что это прискорбно. Рукописи, дающие полное описание некоторых из этих явлений, находятся в стадии подготовки. Поскольку для выполнения этой задачи потребуется много времени, автор решил представить этот краткий отчет об общем характере исследования, а также о сделанных выводах и интерпретациях. В этом отчете будут даны только краткие резюме некоторой относящейся к делу информации, которая позволила сделать выводы, которые будут представлены. Эти выводы касаются происхождения мутабельных локусов, событий, происходящих в этих локусах, которые приводят к изменению фенотипической экспрессии, причин изменения частоты видимых мутаций в этих локусах, факторов, контролирующих время, когда мутации произойдут, образование мутаций в локусе — ₁ кукурузы без присутствия Dt и гетерохроматина в качестве вероятного контролирующего фактора.

Удачное открытие было сделано на раннем этапе изучения изменчивых локусов, которое, как оказалось, имеет исключительную важность для выявления видов событий, связанных с их происхождением и поведением. В коротком плече хромосомы 9 был обнаружен локус, в котором в соматических клетках происходили разрывы. Время и частота событий разрыва, происходящих в этом локусе Ds (диссоциация), оказались такими же, как время и частота событий, вызывающих мутации, происходящих в некоторых мутабельных локусах. ⁴ Обширное исследование локуса Ds показало причину этой взаимосвязи и дало информацию, необходимую для интерпретации событий, происходящих в мутабельных локусах. Был сделан вывод, что измененные фенотипические выражения таких локусов связаны с изменениями в элементе хроматина, отличном от того, который составляет сами гены, и что мутабельные локусы возникают, когда такой хроматин вставляется рядом с генами, которые демонстрируют неоднородную экспрессию. События, происходящие с этим вставленным хроматином, отражаются в изменении экспрессии соседних генов или иногда в потере этих генов.Именно вставленный материал претерпевает «мутационные» события. Локус Ds состоит из такого материала.

Различные типы изменений наблюдаются как следствие событий, происходящих в локусе Ds . Некоторые из этих изменений напоминают эффекты, производимые рентгеновскими лучами, ультрафиолетовым светом, химическими веществами и т. Д. Они включают разрыв и слияние хромосом. Однако разрывы связаны с событиями, происходящими в одном конкретном локусе хромосомы — локусе Ds .Обозначение Ds было дано этому локусу, потому что диссоциация, которая, как теперь известно, связана с образованием дицентрических и ассоциированных ацентрических хроматид, была распознана до того, как были раскрыты другие события, происходящие на Ds . Некоторые из событий, происходящих в Ds , если рассматривать их без ссылки на все известные события, сами по себе не предполагают, что изменившиеся условия в этом локусе связаны с феноменом, вызывающим поломку. Все они могут быть объяснены, однако, предположением, что имеет место один вид изменения встроенного хроматина (хроматина локуса Ds ), и что различные виды наблюдаемых изменений представляют собой последствия этого одного измененного состояния.Предполагается, что это состояние представляет собой липкость материалов, составляющих локус Ds , которая возникает только в определенные моменты развития ткани. Вскоре будет рассмотрен контроль времени этого измененного состояния. Причины для предположения, что изменение было липким, будут очевидны из следующего списка известных событий, которые связаны с локусом Ds . Это: (1) образование дицентрических хроматид со слиянием сестринских хроматид в месте расположения Ds. Это сопровождается образованием ацентрического фрагмента, состоящего из двух сестринских сегментов этого плеча, от Ds до конца плеча. (2) Потеря детектируемой активности Ds без видимого изменения хромосомы. В некоторых случаях потеря активности Ds предположительно связана с потерей самого локуса. (3) Делеции сегментов хроматина различной длины, прилегающих к Ds , обычно с сопутствующей потерей активности Ds , но иногда без потери этой активности.(4) Взаимная транслокация с участием хромосомы 9, в которой одна точка разрыва находится на Ds . (5) Дупликации сегментов хромосомы 9, инверсия или кольцевые хромосомные образования с участием хромосомы 9 с одним разрывом в локусе Ds . (6) Транспозиция активности Ds из одного положения в другое в хромосомном комплементе с или без ассоциированной грубой хромосомной перестройки. (7) Изменения в самом локусе Ds , которые приводят к точным изменениям относительной частоты возникновения указанных выше типов событий в будущих поколениях клеток и растений.Это последнее событие, имеющее большое значение, было названо «изменением состояния» локуса Ds . Из исследования прогрессии изменений состояния Ds в поколениях клеток и растений выяснилось, что различные состояния могут отражать количество встроенного хроматина, локусы Ds с большим количеством этого материала демонстрируют высокую частоту. последствий (1), (3), (4), (5) и (6) выше, и те, у которых меньше этого материала, демонстрируют высокие частоты последствий (2) выше.

Именно из транспозиций Ds могут возникнуть некоторые из новых мутабельных локусов. Механизм транспозиции подвергся серьезным исследованиям. Некоторые случаи транспозиции Ds связаны с грубой хромосомной перестройкой. В этих случаях происходят два разрыва хромосом, которые приводят к перестройке; один разрыв отмечает известное положение Ds в хромосоме до того, как произошла перестройка, а второй разрыв отмечает новое положение активности Ds .Сестринские хроматиды поражаются в каждом из этих двух положений разрыва. Для нескольких из этих случаев было определено, что появление активности Ds в новом положении, скорее всего, возникло во время происхождения грубой хромосомной перестройки. Один случай транспозиции Ds имел особое значение, поскольку он иллюстрирует, как могут возникать новые мутабельные локусы, связанные с изменениями в экспрессии генов. Этот транспонированный локус Ds появился в единственной гамете растения, несущего хромосомы 9 с доминантным аллелем C .Эта гамета несла локус Ds , который был перенесен из известного положения в хромосоме 9 в новое положение в той же хромосоме. Хромосома, имеющая Ds в этом новом положении, была морфологически нормальной по внешнему виду. Это новое положение Ds соответствовало известному расположению C ( C , цветной алейрон, преобладающий над c , бесцветный алейрон). Все вышеперечисленные события теперь происходили на этой новой позиции.Примечательно, что появление активности Ds в этом новом месте коррелировало с исчезновением нормального действия локуса C . Полученный фенотип был таким же, как у известного рецессивного, c . Из предыдущих исследований было определено, что дефицит локуса C приведет к фенотипу c . То, что фенотип c в этом случае был связан с появлением Ds в локусе C , а не из-за недостатка, стало очевидным, поскольку мутации в этом локусе с c до полного Произошла фенотипическая экспрессия C .Можно было показать, что когда действие C снова появилось, действие Ds одновременно исчезло из этого локуса. Восстановленное действие C было постоянным; в этом локусе C больше не происходило событий типа Ds . В большинстве случаев событие, приводящее к восстановлению действия C , не привело к изменению морфологии хромосомы 9. Потеря активности Ds без сопутствующих структурных изменений хромосомы является результатом события (2), описанного выше.

Другие перечисленные события, связанные с активностью Ds , также происходили в этом мутабельном локусе c . Образования дицентрических хроматид не были связаны с появлением фенотипа C , что позволяет предположить, что встроенный ингибирующий материал, составляющий Ds , может располагаться проксимальнее локуса C . Было обнаружено несколько случаев транспозиции Ds из этого места в другое место в коротком плече хромосомы 9.В каждом случае восстановленное действие C было связано с исчезновением активности Ds в локусе C и появлением активности Ds в новой позиции. Изменения в состоянии Ds в этом мутабельном локусе c (событие (7) выше) особенно значительны, поскольку было определено, что конкретное изменение состояния Ds часто сопровождается определенным изменением частоты от c до C мутаций.

Происхождение и поведение этого мутабельного локуса c было интерпретировано следующим образом: вставка хроматина, составляющего Ds , рядом с локусом C отвечает за полное ингибирование действия C . Может произойти удаление этого чужеродного хроматина. Во многих случаях механизм, связанный с этим удалением, приводит к восстановлению прежней генной организации и действия. Материал Ds и его поведение ответственны за происхождение и проявление нестабильности мутабельного локуса c .В механизмах, вызывающих мутации, задействовано только Ds . В локусе C мутации гена не происходят; восстановление его действия происходит за счет удаления ингибирующего хроматина Ds . Возможный характер вставленного материала будет рассмотрен позже.

В культурах, имеющих Ds , продолжают возникать другие мутабельные локусы. Они демонстрируют типы поведения, подобные описанному для мутабельного локуса c . Этот мутабельный локус c (названный c-m1 , потому что он был первым из мутабельных локусов c , выделенных в этих культурах) принадлежит к группе мутабельных локусов ( a ).В некоторых потомках исходных самоопыляемых культур другие мутабельные локусы c произошли из ранее нормальных локусов C . Один из них, c-m2 , показывает выражение типа ( c ) пестролистности, которое заметно отличается от того, что показано c-m1 . Широкий диапазон количественной экспрессии, по крайней мере, двух различных реакций, связанных с образованием алейронового пигмента, является следствием различных мутаций в этом локусе. Промежуточные аллели, полные аллели дикого типа и некоторые аллели, демонстрирующие даже более сильную фенотипическую экспрессию, чем аллели дикого типа, от которых он произошел, производятся мутациями в c-m2 .Мутации часто выражаются в виде двойных секторов, причем глубина цвета в одном секторе больше, чем в сестринском секторе. Эти близнецовые сектора могут отражать единичное вызывающее мутацию событие в локусе c-m2 , которое затрагивает обе сестринские хроматиды. Также было определено, что в этом локусе может происходить разрыв хромосом.

Фенотипические выражения, возникающие в результате мутаций c-m2 и c-m1 , явно сильно различаются. То, что это различие может быть связано с различиями во встроенном хроматине, подтверждается появлением мутабельного локуса wx , возникающего из локуса Wx в гамете растения, несущего c-m2 ( Wx , крахмал эндосперм окрашивается в синий цвет с помощью йода; wx , рецессивный аллель, крахмал окрашивается в красный цвет с помощью йода; расположен в коротком плече хромосомы 9, проксимальнее C ).Тип пестроты, выраженный этим мутабельным локусом wx ( wx-m1 ), поразительно сходен во всех отношениях с локусом c-m2 . В этом случае нельзя было определить, что имело место транспозиция в локус Wx того же ингибирующего вещества, которое индуцировало c-m2 . Такое событие можно предположить на основании известных способностей этого материала к перемещению.

В этом отчете Ds , c-m1 , c-m2 и wx-m1 были использованы в качестве иллюстраций вновь возникающих мутабельных локусов, поскольку все они требуют активатора и все реагируют на один и тот же активатор.Этот активатор получил обозначение Ac . Обширные исследования Ac показали, что он передается по наследству как единое целое. Тем не менее, он показывает очень важную характеристику, которая не проявляется в исследованиях наследования обычных генетических факторов. Эта характеристика такая же, как у DS . Транспозиция Ac происходит из одной позиции хромосомного дополнения в другую — очень часто с одной хромосомы на другую. Опять же, как и в Ds , изменения состояния могут происходить в локусе Ac .Эти изменения состояния бывают двух основных типов: либо изменения, которые напоминают известные эффекты, вызываемые разными дозами локуса Ac , из которого он был получен, либо изменения, которые приводят к явно измененному времени действия и дозовой реакции Ac. . Ac может быть обнаружен и его действие изучено путем наблюдения за мутациями, происходящими в мутабельных локусах, требующих его присутствия для экспрессии мутабельности. Следует подчеркнуть, что, когда в ядре нет Ac , не происходит событий, вызывающих мутацию, на c-m1 , c-m2 или wx — m1; , ни каких-либо событий разрыва хромосом при Ds , так как таких событий не происходит.В качестве примера такого взаимодействия можно указать, что c-m1 поддерживалось в культурах, не имеющих локуса Ac , в течение нескольких поколений и давало полностью бесцветный алейрон без свидетельств мутаций от c до C . Точно так же различные количественные аллели, возникающие в результате мутаций c-m2 или wx — m1 , могут сохраняться без мутаций, если Ac удаляется из ядра соответствующими скрещиваниями.Таким образом, можно выделить и сохранить серию стабильных рецессивных мутаций или стабильных аллелей мутабельного локуса (если хромосомный набор нормален, см. Ниже). Однако, когда Ac возвращается в ядро, нестабильность может снова появиться.

Дозированное действие Ac может быть изучено на диплоидном растении или в триплоидной ткани эндосперма ядер. Когда заметные дозовые эффекты производятся определенным состоянием Ac , они одинаково регистрируются как в растении, так и в тканях эндосперма; чем выше доза Ac , тем более отсроченным является время появления мутаций в мутабельных локусах, контролируемых Ac .Таким образом, Ac определяет не только процесс мутации в этих мутабельных локусах, но также время, в которое мутации происходят, различные состояния Ac дают разное время появления в 1, 2 или 3 дозах. Описано действие Ac на мутабельные локусы, которые он контролирует. Считается, что это действие вызывает липкость ингибирующих материалов, прилегающих к пораженным локусам. Со ссылкой на Ds были перечислены наблюдаемые последствия этой липкости.Это физическое изменение, вероятно, имеет место во встроенных ингибирующих материалах во всех контролируемых Ac мутабельных локусах одновременно в одной и той же клетке. Этот последний вывод основан на наблюдении, что мутации происходят одновременно в двух или более Ac -контролируемых мутабельных локусах, когда они присутствуют в одном и том же ядре. Сходство типа наследования и поведения Ds и Ac было указано выше. Другое сходство состоит в том, что изменения в состоянии, потеря или транспозиция Ac происходят одновременно с изменениями, происходящими в контролируемых Ac мутабельных локусах.Похоже, что изменения физических свойств специфического ингибирующего хроматина в мутабельных локусах и в Ac имеют одинаковую природу, и что все они являются выражением первичного генетического действия материала, составляющего Ac. Предполагается, что Ds и Ac состоят из одного и того же или аналогичного материала. Возможный состав этого материала будет рассмотрен в ближайшее время.

Изучение Ac и Ac -контролируемых мутабельных локусов позволило интерпретировать многие паттерны пестролистности, проявляемые мутабельными локусами.Пестрый узор отражает время и частоту появления видимых изменений фенотипа. Частота появления видимой мутации не обязательно должна отражать частоту событий, которые происходят в мутабельном локусе, как ясно показало исследование c — m1 . Видимые мутации отражают только частоту одного или нескольких конкретных последствий одного первичного типа события, происходящего с ингибирующим материалом, смежным с пораженным геном.Изменения в состоянии этого ингибирующего материала, которые возникают как одно из последствий первичного события, приводят к изменениям относительной частоты последствий этого события, когда оно снова происходит в будущих поколениях клеток и растений. Такие изменения состояния отражаются либо в увеличении, либо в уменьшении относительной частоты появления видимых мутаций. Исследование Ac показало природу контроля времени, когда мутации произойдут в этих мутабельных локусах.Различные дозы Ac вместе с измененными состояниями Ac контролируют время появления этих мутаций. Таким образом, изменения во времени появления видимых мутаций являются отражением изменений дозировки или изменений состояния Ac.

Мутабельные локусы, которые не требуют активатора, демонстрируют те же виды экспрессии пестроты, что и мутабельные локусы, требующие активатора. Было показано, что изменения, происходящие на Ac , во многом аналогичны изменениям, происходящим на Ds. Таким образом, Ac или Ac -подобные локусы могут быть ответственны за происхождение новых мутабельных локусов при транспозиции в положение, прилегающее к гену, ингибируемое действие которого может быть обнаружено по видимому изменению фенотипа. Действие дозировки может проявляться такими автономными мутабельными локусами, а также различными «изменениями состояния», отражающимися изменениями в фенотипической экспрессии, а также временем и частотой появления видимых мутаций затронутых генов. Изучение поведения Ds в нескольких его состояниях позволяет переосмыслить паттерны пестроты у Drosophila, которые в некоторых случаях, по-видимому, связаны с потерей сегментов хромосом, а в других случаях — с изменениями в степень действия задействованных генов.Это также позволяет интерпретировать сообщаемый «эффект положения» у Oenothera, потому что события, ответственные за изменения фенотипа и появление дупликаций и дефектов в этом организме, по-видимому, такие же или аналогичные тем, которые описаны для Ds . в кукурузе. ⁵

Теперь можно рассмотреть возможный состав Ac . До недавнего времени расследование не было сосредоточено на этой проблеме. Однако считается, что этот материал, вероятно, является гетерохроматином.Это утверждение частично основано на очевидной гомологии в экспрессии пестролистности у кукурузы и дрозофилы, но более убедительно подтверждается результатами предварительного эксперимента, сфокусированного на индукции мутаций в локусе , , _{, 1,} и др. кукурузы при отсутствии известного локуса Dt (пунктирный). Действие Dt в хромосоме 9 на — локус ₁ в хромосоме 3 очень похоже на действие Ac на мутабельные локусы, которые он контролирует. ⁶ Сходства слишком велики, чтобы их можно было отбросить как следствие причинно-несвязанных явлений. Локус Dt активирует локус a ₁ ; встречаются мутации в высшие аллели A ₁ ( A ₁ , окрашенный алейрон; a ₁ , бесцветный алейрон, рецессивный к A ₁ ). Было показано, что без Dt в ядре a ₁ является полностью стабильным. Dt расположен в гетерохроматическом выступе , заканчивающем короткое плечо хромосомы 9. Сразу возникает подозрение: вызвано ли действие Dt некоторой модификацией гетерохроматического выступа в хромосоме 9? Если да, может ли эта модификация быть произведена заново, подвергнув хромосому 9 циклу разрыва-слияния-моста? Возникнут ли эффективные изменения выступа непосредственно из-за индуцированных изменений, или же они будут вызваны вторично каким-либо другим индуцированным структурным изменением, либо в коротком плече хромосомы 9, либо где-либо еще, что каким-то образом нарушит нормальное функционирование вещества ручки и, таким образом, изменить ее действие? Этот последний вопрос уместен, потому что некоторые структурные изменения у Drosophila, по-видимому, влияют на функционирование центрально расположенного гетерохроматина.Например, некоторые минуты вызывают элиминацию хромосом и «соматический кроссинговер», оба из которых вполне могут быть связаны с адгезиями определенного гетерохроматина, которые происходят в определенные периоды развития. ⁷ Чтобы ответить на вышеуказанные вопросы, растения, гомозиготные по a ₁ и не имеющие локуса Dt (обозначенного Rhoades dt ), были скрещены с растениями, аналогичным образом составленными со ссылкой на a ₁ и . dt , но несет перестройку короткого плеча хромосомы 9, которая вводит хромосому 9 с новым сломанным концом во многие из первичных ядер эндосперма в данном скрещивании. ⁸ Циклы разрыва-слияния-мостика, включающие такую ​​хромосому 9 с недавно разорванным концом, будут происходить во время развития ядер. Некоторые из этих сломанных хромосом 9 будут иметь выступ, который затем может быть подвергнут модификациям в результате событий разрушения. Если некоторые из этих модификаций привели к тем же условиям, которые присутствовали в Dt , мутации от a ₁ до A ₁ могли появиться в некоторых ядрах, полученных в результате скрещивания.Изготовлено большое количество крестов этого типа. Результаты были положительными в отношении индуцирования мутаций от a ₁ до A ₁ . Небольшое количество ядер, полученных в результате этих скрещиваний, показало мутации от a ₁ до A ₁ . Часто на ядре присутствовало только одно маленькое пятно A ₁ . Однако некоторые из ядер имели набор мутаций от a ₁ до A ₁ , что было неотличимо от такового, произведенного Dt. Эти ядра не могли возникнуть в результате заражения, так как никогда не были получены стоки с известным локусом Dt , и, следовательно, в поле не могло быть растений с этим локусом. Кроме того, акции a ₁ и dt , первоначально полученные от Rhoades, выращивались в течение нескольких лет. Ежегодно производилось несколько скрещиваний сибсов, и в ядрах этих колосьев не наблюдалось мутаций a ₁ — A ₁ .

Факты (1), что Dt расположен в гетерохроматическом выступе хромосомы 9, (2) эффект, который он производит, можно воссоздать, подвергнув хромосому 9 циклу разрыва-слияния-моста, (3) что Ac появился в запасах, прошедших этот цикл, и (4) что Ac и Dt схожи в своих соответствующих действиях, все указывает на гетерохроматин как на материал, составляющий Ac. Всплеск новых мутабельных локусов, который появился в самоопыляемом потомстве растений, подвергшихся хромосомному типу цикла разрыва-слияния-моста, становится понятным, если учесть, что изменения количества или структуры гетерохроматических элементов во время этот цикл был в первую очередь ответственен за первоначальное появление этих мутабельных локусов.Этот отчет показал, что при возникновении таких локусов возникают другие мутабельные локусы посредством транспозиции ингибирующих веществ хроматина в другие локусы, которые, в свою очередь, становятся мутабельными.

Почему измененный гетерохроматин должен быть ответственным за запуск такой цепи событий? Чтобы ответить на этот вопрос, необходимо сосредоточить внимание на действии гетерохроматина в нормальном ядре. Было указано, что это связано с обменом веществ между ядром и цитоплазмой. ⁹ Изменения количества, качества или структурной организации гетерохроматических элементов могут изменить вид и / или степень конкретных обменов, которые происходят, и таким образом контролировать организацию хромосом, а также вид и относительную эффективность генного действия.Не может быть сомнений в том, что происходит транспозиция как Ds , так и Ac и что время их появления в развитии ткани находится под точным контролем. Этот контроль определяется количеством присутствующих локусов Ac и их организацией и, возможно, их положением в хромосомном комплексе. Это транспозиция гетерохроматина? Является ли это отражением процесса, который обычно происходит в ядрах? Отвечает ли он за контроль скорости и типов обмена, происходящего между ядром и цитоплазмой? Обычно это упорядоченный механизм, связанный с управлением процессами дифференциации? Если это так, индуцированные нарушения количества и организации гетерохроматических элементов хромосомы могут вызвать серию изменений, отражающихся как в структуре и поведении хромосомы, так и в генных реакциях, которые могут заметно изменить фенотипические проявления. ¹⁰ Хорошо известно, что различные выступы и центромеры могут сливаться в покоящихся ядрах. Это слияние также часто наблюдается как в соматической, так и в мейотической фазах. Являются ли транспозиции и изменения состояния Ac продуктами этого слияния? Это подозревается из-за частой транспозиции Ac с одной хромосомы на другую.

Можно считать, что эти предположения относительно поведения и функции гетерохроматина зашли дальше, чем того требуют доказательства.Это может быть правдой; но нельзя отрицать, что в основе проявления разнообразия кукурузы лежит один основной вид явления. Во многих случаях не может быть сомнений в сходстве в выражении пестроты у дрозофилы и кукурузы. Неоднократно обнаруживалось, что гетерохроматический элемент в основном связан с происхождением и проявлением пестроты у Drosophila. То, что гетерохроматический элемент также ответственен за происхождение и поведение пестролистности кукурузы, не было доказано, хотя это указано, как показал анализ Dt .

Лекция 4. Гетерозиготность

Лекция 4. Гетерозиготность Лекция 4. Population Genetics II

Гетерозиготность, H _Exp (или генное разнообразие, D )

Перейти на веб-страницу, описывающую, как рассчитать F _ST по гетерозиготности.

Возврат на главную страницу указателя

Гетерозиготность представляет большой интерес для студентов генетическая изменчивость в естественных популяциях.Часто бывает одним из первых «параметры», которые представлены в наборе данных. Это может нам многое сказать о структуре и даже истории населения. Например, очень низкая гетерозиготность по аллозимным локусам у гепардов и черноногих хорьки указывают на серьезные последствия небольшого размера популяции (узкие места популяции или динамика метапопуляции, которая серьезно снизила уровень генетической изменчивости относительно ожидаемого или обнаруженного у сопоставимых млекопитающих). Высокая гетерозиготность означает большую генетическую изменчивость.Низкая гетерозиготность означает небольшую генетическую изменчивость. Часто мы будем сравнивать наблюдаемый уровень гетерозиготности с тем, что мы ожидаем при равновесии Харди-Вайнберга (HWE). Если наблюдаемая гетерозиготность ниже ожидаемой, мы стремимся приписать несоответствие таким силам, как инбридинг. Если гетерозиготность выше ожидаемой, можно заподозрить эффект разрушения изолята (смешение двух ранее изолированных популяций).

Существует несколько показателей гетерозиготности.Значение из этих показателей будет варьироваться от нуля (отсутствие гетерозиготности) до почти 1,0. (для системы с большим количеством одинаково часто встречающихся аллелей). Мы основное внимание будет уделено ожидаемой гетерозиготности ( H _E , или генное разнообразие, D , как предпочитает называть это Брюс Вейр). Простейший способ вычислить его для одного локуса:

Уравнение 4.1

где p _i — частота i ^th аллелей k . [Обратите внимание, что р. ₁ , р. ₂ , п. ₃ и т. д. могут соответствовать тому, что вы обычно думаете как p , q , р , с так далее.]. Если мы хотим разнообразия генов по нескольким локусам, нам нужно двойное суммирование и следующие индексы:

Уравнение 4.2

где первое суммирование для l ^th («ell ^th «) из м локусов. [Обратите внимание, что мы усредняем м loci через термин 1/ m ]. Второе суммирование такое же, как в уравнении 4.1.

Почему стоит взять сумму квадрата гена частоты и вычесть это из единицы? Давайте вернемся к основному Харди-Вайнбергу:

p ² + 2 pq + q ² = 1 Уравнение 4.3

где гетерозиготность равна 2 pq . В остальная часть выражения ( p ² + q ² ): homo zygosity. Если мы хотим гетерозиготности, мы просто вычитаем что из общей суммы. Всего с двумя аллелями не так эффективно вычислять гетерозиготность по схеме «один минус гомозиготность». Рассмотреть возможность случай, однако, с локусом с 6 аллелями. Имеет 21 возможный генотип — 6 видов гомозигот и 15 видов гетерозигот.Написание, 6 + 5 + 4 + 3 + 2 + 1 = 21 = [6 * (6 + 1)] / 2 — это формула для комбинаций шести вещи взяты по два за раз, порядок не важен — [ n ( n +1)] / 2. Чем больше аллелей, тем проще становится просто возвести в квадрат частоты генов и затем суммировать, по сравнению с перечислением всех возможных гетерозигот и вычисление (возможно, очень многих) различных частот гетерозигот. Мы торгуем небольшой неэффективностью на двухаллельных системах для гораздо большей эффективности. с мультиаллельными системами.

О чем говорит нам гетерозиготность и какие закономерности возникают при переходе к мультиаллельным системам? Возьмем пример. Скажите p = q = 0,5. Описана гетерозиготность по двухаллельной системе. по вогнутой вниз параболе, которая начинается с нуля (когда p = 0) идет до максимума при p = 0,5 и возвращается к нулю при p = 1. Фактически, для любой мультиаллельной системы гетерозиготность максимальна, когда

p ₁ = p ₂ = p ₃ =.p _к Ур. 4.4

то есть, когда частоты аллелей равны. В максимальная гетерозиготность для 10-аллельной системы наступает, когда каждый аллель имеет частота 0,1 — D или H _E тогда равна 0,9. Позже мы увидим, что самый простой способ просмотра F _ST (мера дифференциации субпопуляций) будет как функция различия в гетерозиготности O , H _o , и ожидаемая гетерозиготность E , H _E , что мы только что вывели.

Гетерозиготность глазами человека

Вот как я люблю думать о гетерозиготности. ( H _E или D ). Это (ожидаемая) вероятность того, что индивидуум будет гетерозиготным по данному локусу (или по исследуемому loci для системы с несколькими локусами). Для многих микросателлитных локусов человека, для Например, H _E часто> 0,85, что означает, что у вас > 85% шанс быть гетерозиготой.

Теперь, когда у вас есть способ рассчитать генетическое разнообразие / ожидаемое гетерозиготность, вы готовы рассчитать статистику F по методу из:

F _IS = ( H _S — H _I ) / H _S Уравнения 4.5

F _ST = ( H _T — H _S ) / H _T

F _IT = ( H _T — H _I ) / H _T

Как показано в отработанной демо-странице статистики F .

Если вы запустите некоторые данные с помощью уравнений 4.